大木研究所出现在《
宝可梦红·绿》、《宝可梦蓝》、《宝可梦皮卡丘》、《宝可梦火红·叶绿》、《宝可梦心金·魂银》以及《宝可梦 Let's Go! 皮卡丘·Let's Go! 伊布》游戏中。在《宝可梦红·绿》、《宝可梦蓝》、《宝可梦皮卡丘》、《宝可梦火红·叶绿》和《宝可梦 Let's Go! 皮卡丘·Let's Go! 伊布》中,大木博士在这里把最初的伙伴和
图鉴送给主角。
研究所位在主角家与劲敌家下方,是一栋不太大的房子,在每一代游戏中都稍有不同。研究所里有三名研究员、一堆书、放着三个
精灵球的桌子、一台
电脑、两台图鉴以及一些给主角的
小贴士。在《皮卡丘》中,桌上只有一个精灵球;在《火红/叶绿》中则多出来一台神秘的机器;《Let's Go! 皮卡丘/Let's Go! 伊布》有三个精灵球的底座,但只有左右两个精灵球,直到主角剧情收服
皮卡丘/
伊布时,中间才多出一个精灵球。
研究所在第一集中出现,小智在这里得到了他的
皮卡丘。之后在每次小智完成一个地方的冒险之后,或者准备开始新的冒险之前,都会回到这里来。研究所位在
真新镇的一座小山头上,研究所旁边有一个大风车。每次小智获得了6只宝可梦之后,新的宝可梦都会自动传送到这里(宝可梦 超级愿望中则不是这样)。另外小智在前往丰缘、合众、
卡洛斯地区的时候,都把所有宝可梦留下,只带着皮卡丘前往。(
神奥地区是个例外,因
长尾怪手偷偷跟着小智。)
起居室是
大木博士生活休息的地方,可能偶尔也用于学习。粉色的地毯,两张沙发还有一张桌子,两边是电脑和书架。另外还有两间放满奇怪仪器的研究室。
上楼以后是研究区。这里有很多机器,是研究所的心脏。包括宝可梦测试所用的机器,还有放满药品的桌子。机器旁边有把蓝色的椅子,面前是可以显示宝可梦健康程度的屏幕。大木博士的电脑也在这里,记录大木博士的研究成果,并包括有可视通讯功能。电脑旁边是精灵球传送系统。屋里也有书柜、沙发一类,另外还有一个液体瓶,也许有特殊用途。
室外研究区是宝可梦生活的区域,根据宝可梦的属性及习性不同而划分成几个区域。有的时候宝可梦并不太适应这里,所以像是
小智的
妙蛙种子自愿承担起调停的工作。
在宝可梦特别篇漫画中,
小智为了成为最厉害的宝可梦训练家而来到研究所。研究所是一栋1层混乱无章的小建筑,小智擅自进入研究所并不小心打开了储藏了宝可梦的精灵球。
在《宝可梦心金·魂银》中,大木研究所中的背景音乐和
真新镇相同。在宝可齿轮的收音机中可以听到大木研究所的专属背景音乐。在《宝可梦 Let's Go! 皮卡丘·Let's Go! 伊布》中,大木研究所右边角落书架上有一本画册,这和动画电影《
宝可梦:时拉比 穿梭时空的相遇》中大木博士年轻时使用的画册一致。