弗朗切斯科二世·贡扎加（Francesco II Gonzaga； 1466年-1519年），曼图亚侯爵。

弗朗切斯科·贡扎加是曼图亚侯爵费代里科一世·贡扎加与巴伐利亚的玛格丽特的儿子。1484年成为新任曼图亚侯爵弗朗切斯科二世·贡扎加。1490年2月12日，弗朗切斯科与伊莎贝拉·德斯特结婚，伊莎贝拉是费拉拉公爵埃尔科莱一世·德斯特的女儿。两人婚后生育了七名子女。1519年弗朗切斯科二世·贡扎加去世，他的儿子费德里科二世·贡扎加成为新任曼图亚侯爵。