晋武帝太康三年(282年)，分建安郡地设晋安郡，治所侯官县（今福州鼓楼区），隶属扬州，辖原丰、侯官、罗江、宛平、温麻、晋安、同安、新罗8县。晋惠帝元康元年(291年)，晋安郡改隶江州(治所在豫章，今江西南昌)。

西晋析建安郡置晋安郡，郡治在今福州，管辖除今南平地区、三明地区大部分外的福建大部分地区 。隶属扬州。

南朝宋初年，晋安郡隶属江州(治所移至柴桑，即今九江市西南，后移治浔阳，即今九江市区)。宋明帝泰始四年(468年)，晋安郡改名晋平郡，旋为晋平王国。不久，复名晋安郡。

南朝梁武帝普通六年(525年)，晋安郡和建安郡、义安郡、永嘉郡、会稽郡同属东扬州。南朝陈武帝永定元年(557年)，升晋安郡为闽州，管辖晋安、建安、梁安3郡，福州为州治所。晋安郡为闽州治所。 后析出晋安郡南部、西南部设置南安郡，南安郡郡治在晋安县，今福建南安市。 陈文帝天嘉六年(565年)，撤销闽州，晋安仍属东扬州。陈废帝光大二年(568年)，晋安郡为丰州治所。北宋地理全书《舆地纪胜》：“南安郡，陈属闽州，在永定元年。后属丰州。光大元年，陈文置南安郡……隋文平陈郡废属泉州”

隋灭陈后，于开皇九年(西元589年)改丰州为泉州，不久废建安、南安、晋安三郡，州直接辖县。晋义熙九年(413年)置绥安县，隋炀帝大业三年(607年)，绥安县并入建安郡的龙溪县，潮汕东部地方改属建安郡。大业三年(607年)，把原设建安、晋安、南安三郡合并为一，称建安郡；三郡之下原设十五个县，撤并为四；郡治由建安(今建瓯)移至闽县(今福州)。

隋开皇九年(589年)，丰州因州治(今福州)有泉山，改名泉州。 东部侯官改名原丰县，县治在今鼓楼区。

开皇十二年(592年),原丰县改称闽县。 大业二年(606年),改泉州名为闽州。

大业三年(607年)，废闽州，改名恢复建安郡，辖闽县、建安、南安、尤溪4县，郡治在闽县。隋时，州置刺史；另置长史、司马、录事参军事及功曹与户、兵等曹参军事。郡置太守、丞、尉等。炀帝时罢州置郡，郡置太守。