毓贤（1842年－1901年2月22日），字佐臣，是清朝末年著名的酷吏和极端排外人士。内务府汉军正黄旗，捐监生，纳赀为同知府。他与刚毅的恶行都因为刘鹗的《老残游记》而记载在历史中，他们都是“清官若自以为是、危害比贪污严重”的代表。

监生出身。

清光绪五年（1879年），由选用同知捐纳知府派分山东。

十五年（1889年），署曹州知府。任职期间，不分良莠，一以诛戮为事，残酷镇压人民的反抗斗争，颇得上司赏识。

二十一年（1895年）升授山东兖沂曹济道，二十二年补山东按察使，奉命镇压曹县、单县大刀会起义。

二十四年（1898年）升山东布政使，同年八月调湖南布政使，十一月署江宁将军。次年二月授山东巡抚。

光绪二十六年（1900年），毓贤出任山西巡抚，仍坚持仇教排外。八国联军攻陷天津后，毓贤率兵勤王，并随慈禧太后逃往西安。

清廷与八国联军议和时，联军指毓贤为罪魁祸首。1900年9月26日，山西巡抚毓贤以被革职，发配新疆。

光绪二十七年（1901年）2月13日，清廷下令加重对“首祸诸臣”之惩处：毓贤即行正法。诏书在甘肃追上了毓贤。22日，毓贤被斩于兰州。

据说李鸿章临终时嘴里还在痛骂“毓贤误国”。毓贤其人虽以残忍著称，但并不贪污，死后山西还有人建祠堂供奉，但被清政府勒令拆掉。

第一联云：“臣死国，妻妾死臣，夫复奚疑，最难老母九旬，稚女十龄，未免凋伤慈孝治；我杀人，夷狄杀我，亦有何憾。所愧奉君廿载，历官三省，空嗟辜负圣明恩。”第二联云：“臣罪当诛，臣志无他，念小子生死光明不似冤沉三字狱；君恩我负，君忧谁解，愿诸公老成谋国，切须早慰两宫心。”（两宫指慈禧和光绪）

1889年任山东曹州知府，以善治盗闻名，3个月杀掉2000多人。其任职期间，不分良莠，一以诛戮为事，残酷镇压人民的反抗斗争，颇得上司赏识。1896年升至山东布政使、湖南布政使、江宁将军。1897年山东发生曹州教案，大刀会杀德国教士二人，原山东巡抚李秉衡免职，毓贤1899年升任山东巡抚。毓贤认为“民心可用”，对义和拳采用抚的办法，将其招安纳入团。于是义和拳成了合法组织义和团，并授“毓”字旗。毓贤纵容拳民烧教堂、杀教士。教士求保护，毓贤下令置之不理。后清廷受外国压力将毓贤撤职。毓贤可能是近代史上的山西巡抚中折腾的最凶、影响最大的一位了。他在位时，不光山西人知道他，大清国朝野上下都知道他，就连许多西方国家也都知道山西，知道巡抚毓贤。他堪称有“国际影响”的人物了。

毓贤在曹州任知府4年，在官场上的外号为“屠户”，对民众采用大批逮捕、滥用酷刑和大批屠杀的恐怖手段进行统治。他惯用打杖条、打板子、轧杠子、跑铁链子、跪铁蒺藜、站铁鏊、气蛤蟆(令受刑者仰卧，用杠子砸肚子)等酷刑。但最令人发指的是“站木笼”。他在衙门前置木笼12架，每架木笼内壁布满铁钉，把人吊在木笼内，再在人脚下垫几块砖，似踏非踏。这样，人在笼内不能动弹，稍有动弹，肉体就被刺得鲜血淋漓；当人踏到砖时，马上抽去一块，直至把人吊死为止。惨死在木笼内的人几乎天天都有。惯偷杨炮会偷了一个包袱，官军紧追不舍，杨急忙把包袱扔到一家姓于的院内，结果姓于的被“站木笼”致死，全家也被杀害。

毓贤因为血腥镇压曹州人民，官愈升愈大。1899年（清光绪二十五年）四月，升任山东巡抚。一上任，便故伎重演，大肆镇压革命运动。他曾8次下令不准民间私立大刀会、红拳会，不准设场习拳，并在8月杀害了活动于济宁、汶口、巨野等地的义和团首领陈兆举等。曾派济南知府卢昌诒率领几百名骑兵到平原县，在森罗殿开枪击杀群众多人。在义和团反帝斗争方兴未艾之时，又派济宁东道吉灿升督游击马金，率大批军队到茌平镇压。马金以阴谋手段诱捕义和团著名首领朱红灯和心诚和尚。1899年（清光绪二十五年）十二月朱红灯和心诚和尚在济南惨遭杀害。

毓贤在山东当地方官20多年，熟知山东情况。平原事件后，他看到义和团力量仍在发展，同时感到外国教会势力比义和团对清朝统治的威胁更为严重。因此，对义和团的镇压就不像以前那样卖力。他首先改义和拳之名为义和团，采取了由“剿”变“抚”的策略。他在处理平原事件奏报中说：“教堂收纳教民”，“鱼肉良儒，凌轹乡邻。睚眦之嫌，辄寻报复，又往往造谣倾陷”，“百姓遂多不服”，而地方官“办理洋务交涉，多以迁就了事；每接彼族指拿之信，大半逢迎教士，曲从其意。”又说：“东省民风素强，民俗尤厚。际此时艰日亟，当以团结民心为要图。”光绪二十四年，即提出“化私会为公举，改拳勇为民团”的主张，以实现其排外仇教的目的。任山东巡抚后，明确表示“民可用，团应抚”，并特意在省城济南设场招纳拳民，令义和拳民教授兵勇拳艺。他任凭平原、高唐、茌平一带朱红灯、本明和尚（后改名心诚和尚）等义和拳领袖设场授徒，攻击教堂，打击教士。

光绪二十五年（1899年）7月，平原县杠子李庄教民李金榜欺压拳民，知县蒋楷袒护教民，派兵捉拿拳民，引发杠子李庄和森罗殿等地的武装冲突。毓贤闻讯后，一面派兵弹压，一面将蒋楷等人撤职查办，又派济南知府卢昌诒“亲往抚绥”平原义和拳，并通令山东各地义和拳、大刀会等一律改称“民团”，允许朱红灯所部义和拳建旗帜，皆署“毓”字。自此，山东义和拳声势愈张。毓贤对义和团剿抚兼施，但帝国主义仍以镇压不力视其为纵容义和团的“罪魁祸首”。美国驻华公使康格逼迫清政府撤换毓贤。1899年（清光绪二十五年）十一月，清政府禀承帝国主义意旨，撤毓贤，改派袁世凯任山东巡抚。清政府遂将其撤换。毓贤离职前二天，下令在济南杀害了已被诱捕的山东义和团首领朱红灯和本明和尚。

毓贤在京向端王载漪、庄王载勋、大学士刚毅等力荐拳民可用，获准面见慈禧太后，1900年被重新起用为山西巡抚。任山西巡抚时，毓贤排外更加激烈，唆使义和团焚烧教堂及屠杀教民，对拳民首领款若上宾。之后对传教士假称兵力不足，未能在各县对其保护，设计命全省教士集中到省城太原一室之内。于1900年7月9日，在巡抚衙门西辕门前，毓贤将这46人尽数杀害，妇孺皆不免（12名天主教方济各会的意大利籍主教、修士和修女，34名英国浸信会传教士，包括11名幼童）。毓贤亲手杀死天主教山西北境教区正主教艾士杰。山西全省共杀传教士191人、中国教民及其家属子女1万多人，焚毁教堂、医院225所，烧拆房屋两万余间，是各省中死人最多的一个省。事后为此付出的抚恤金和丧葬费等赔款计四百余万两白银。清廷还停止山西人士参加科举考试的资格若干年，以示惩罚。

1900年（清光绪二十六年），毓贤调任山西巡抚。他有意利用义和团来打击帝国主义势力。六月十五日，榆次县什贴镇义和团进入太原时，他即将义和团迎进巡抚衙门，甚至发布告示，表示“支持”义和团打击帝国主义势力。八国联军攻占北京时，被指为排外仇教的“罪首”，革职充军新疆。1901年(清光绪二十七年)在兰州被处死。