西安交通大学档案馆（Archives of Xi 'an Jiaotong University）是西安交通大学下设机构，既是学校档案工作的职能管理部门，又是永久保存和提供利用学校档案的科学文化事业机构。

1957年3月，西安交通大学成立党政联合档案室。

1982年10月，改名为综合档案室。

1987年4月，经原国家教委批准，在综合档案室的基础上，成立了档案馆。

2000年4月，西安医科大学、陕西财经学院与西安交通大学合并，两所学校的档案工作随之纳入西安交通大学档案馆统一管理。

2023年1月，西安交通大学档案馆和西安市档案馆联合申报的“交通大学西迁档案文献”入选《第五批中国档案文献遗产名录》。

对全校档案工作进行规划、组织、协调、监督与指导，对学校各类档案和资料集中统一管理，并为学校和社会提供档案查询服务；负责溯源馆和西迁历史纪念馆的接待和维护等工作，参与校史的科研工作。

截至2020年底，西安交通大学档案馆馆藏档案295865卷，其中历史档案4074卷（含医学院建国前档案646卷）；资料8174册；照片214943张。

西安交通大学档案馆馆藏档案分为10个全宗：1.南洋公学—交通大学（1897年—1959年）；2.商船学校（1912年—1915年）；3.省立医专（1940年—1948年）；4.国立西北医学院（1941年—1949年）；5.西北大学医学院省立助产学校（1947年—1949年）；6.苏南工业专科学校（1948年—1956年）；7.西安动力学院（1955年—1957年）；8.西安医科大学（1949年—2000年）；9.陕西财经学院（1960年—2000年）；10.西安交通大学（1959年—今）。

西安交通大学档案全宗包括西安交通大学1959年—2015年形成的档案177285卷，分党群、行政、教学、科研、产品、基建、设备、出版、外事、财会10个类别；其中党群、行政档案16940卷、教学档案82115卷、科研档案7566卷、产品档案123卷、基建档案6894卷、设备档案705卷、出版档案15400卷、外事档案2182卷、财会档案45360卷；档案涉及到西安交通大学发展过程中的方方面面，在学校教学、科研、党政管理、教学评估、编史修志等方面发挥了作用，是学校各项工作中的重要组成部分。

陕西财经学院档案全宗包括陕西财经学院1960年—2000年形成的档案共12169卷，分为党群行政、教学综合、科研外事、基建、财会以及其他类别档案等10大类；其中党群行政类档案3223卷、教学综合类档案4829卷、科研外事类档案465卷、财务类档案3375卷、基建档案277卷；这些档案资料是陕西财经学院发展变迁的记录，也是西安交通大学馆藏档案的重要组成部分。

西安医科大学全宗包括西安医科大学从1937年成立到2000年与西安交通大学合并前的63年间形成的档案共20170卷，其中1949年以前档案646卷，主要内容包括教育部关于教育工作的训令、学校各项规章制度介绍、学生学习情况介绍以及教职员册等，剩余19524卷档案分党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版、外事、财会以及声像等10大类；这些档案资料不仅反映了西安医科大学六十多年的发展变迁历史，同时也是西安交通大学馆藏档案的重要组成部分。

西安动力学院档案全宗包括西安动力学院1955年—1957年形成的档案共97卷，内容包括党委常委会记录，党委工作纲要及实行党委制的意见，干部任免名单，院长办公会议记录，教学计划，专业设置发展规划建议，各种规章制度，工作纲要，基本建设计划任务书，经费支出决算表，固定资产明细表等；这些档案材料见证了西安动力学院的发展历史，是西安交通大学馆藏档案的重要组成部分。

苏南工业专科学校档案全宗包括苏南工业专科学校1948年—1956年档案共197卷；主要内容有：学校各类会议记录，学校机构设置、组织编制、领导任免、教职工人事变动等文件，学校及各学科概况介绍，学校有关规章制度、学科发展计划及工作总结、报告等，学校有关招生工作的意见、批复及教学计划、实习计划、专业设置、课程安排，学校教职工人员登记表、工资登记表，学校经济情况调查表、经费决算表、毕业生人数统计表、就业情况表，新生录取名单、毕业生分配名单，学生成绩册、学籍管理材料，有关开展政治思想运动的资料，有关校舍调整、设备清查、合并西迁的移交和接管问题等的文件材料。

商船学校档案全宗包括商船学校1912年—1915年形成的档案共37卷，分管理、教学、科研、财会等4类，包括有关学校规章制度介绍、学生成绩公布、学生实习、学校校舍建筑、学生实验设备购置、学校经费筹备、校长及教职员工资福利待遇等方面的内容；本全宗档案反映了商船学校的最初的发展历史。

南洋公学–交通大学档案全宗包含的档案上迄1896年，下至1959年，共3366卷，其中，清代档案85卷；分管理、教学及出版物、科研产品设备、房地产、财会、外事等6大类，包括盛宣怀有关南洋公学的办学奏折和官方文书、《南洋公学章程》《南洋公学高等小学堂章程》《咨呈增设电机、邮政两专科办法》《邮传部上海高等实业学堂出洋留学生章程》等，还记录了盛宣怀、张元济、严复、唐文治、詹天佑、徐世昌、叶恭绰、蔡元培、陆定一、孙科、钱学森、江泽民等人在教育方面的社会活动情况。