钟雅后来南渡到江东避乱，获时任丞相司马睿任命为记室参军，后又先后任临淮内史、振威将军，散骑侍郎，尚书右丞和北军中候等职。后来，跟随大将军
王敦，担任
从事中郎，并替代因父亲逝世而离职的
沈充任宣城
内史。太宁二年（324年），
王敦之乱踏入最后阶段，王敦党羽
钱凤等人起兵作乱。朝廷拜钟雅为
广武将军，率众驻屯青弋，与支持钱凤的
周玘作战，并成功击斩周玘。王敦之乱于当年平定，钟雅亦被征召入朝任尚书左丞。
太宁三年（325年），晋明帝驾崩后，晋成帝继位，钟雅迁任
御史中丞。钟雅任御史中丞时正直执法，违法者都会被他以法检举，百官都因此害怕他。咸和元年（326年），
北中郎将、徐州刺史
刘遐逝世，刘遐部曲因不欲由别人统率而作乱，朝廷命
郭默镇压。钟雅假节、监征讨军事。领导叛变的田防被临淮太守刘矫杀死后，叛变平息，钟雅改拜
骁骑将军。
咸和二年（327年），
苏峻之乱爆发。次年，苏峻叛军逼近建康周围，钟雅受命为前锋监军、假节，领精兵一千，与
卞壸等人与苏峻交战。但钟雅以兵少而不敢进击，同时卞壸大败战死，钟雅于是退还建康，改拜
侍中。不久，
庾亮抵抗失败，并出逃寻阳。苏峻攻入
建康，朝廷百官逃散。只有侍中钟雅独自留在晋成帝身边。钟雅不愿步赵盾的后尘，担心董狐将要拿着
竹简上留下骂名。所以百官奔散的情况下，联合王导、刘超等人共同守卫晋成帝。同年，苏峻因讨伐义军兴起，强迁晋成帝进入石头城，钟雅和刘超流着泪，徒步跟随成帝入石头城。
咸和四年（329年），因苏峻战死，由苏逸接管余众；而勤王军亦士气大振，将攻建康，钟雅、刘超与建康令管斾密谋送成帝离开石头城投奔讨伐军。但密谋败露，苏逸于是命任让捉拿钟、刘二人，虽然成帝哭着抱着二人，要求任让不要带走二人，但任让不听，仍然将二人带走并杀害。
避乱东渡，元帝以为丞相记室参军，迁临淮内史、振威将军。顷之，征拜散骑侍郎，转尚书右丞。时有事于太庙，雅奏曰：“陛下继承世数，于京兆府君（
司马防）为玄孙，而今祝文称曾孙，恐此因循之失，宜见改正。又礼，祖之昆弟，从祖父也。景皇帝（
司马师）自以功德为世宗，不以伯祖而登庙，亦宜除伯祖之文。”诏曰：“礼，事宗庙，自曾孙已下皆称曾孙，此非因循之失也。义取于重孙，可历世共其名，无所改也。称伯祖不安，如所奏。”转北军中候。大将军
王敦请为从事中郎，补宣城内史。
钱凤作逆，加
广武将军，率众屯青弋。时
广德县人周?为凤起兵攻雅，雅退据
泾县，收合士庶，讨之，斩之。凤平，征拜
尚书左丞。
时帝崩，迁御史中丞。时国丧未期，而尚书
梅陶私奏女妓，雅劾奏曰：“臣闻放勋之殂，八音遏密，虽在凡庶，犹能三载。自兹以来，历代所同。肃祖明皇帝
司马绍崩背万国，当期来月。圣主
缟素，泣血临朝，百僚惨怆，动无欢容。梅陶无大臣忠慕之节，家庭侈靡，声妓纷葩，丝竹之音，流闻衢路，宜加放黜，以整王宪。请下司徒，论正清议。”穆后临朝，特原不问。雅直法绳违，百僚皆惮之。
北中郎将
刘遐卒，遐部曲作乱，诏郭默讨之，以雅监征讨军事、假节。事平，拜
骁骑将军。苏峻之难，诏雅为前锋监军、假节，领精勇千人以距峻。雅以兵少，不敢击，退还。拜
侍中。寻王师败绩，雅与刘超并侍卫天子。或谓雅曰：“见可而进，知难而退，古之道也。君性亮直，必不容于寇仇，何不随时之宜而坐待其毙。”雅曰：“国乱不能匡，君危不能济，各逊遁以求免，吾惧董狐执简而至矣。”庾亮临去，顾谓雅曰：“后事深以相委。”雅曰：“栋折榱崩，谁之责也。”亮曰：“今日之事，不容复言，卿当期克复之效耳。”雅曰：“想足下不愧荀林父耳。”及峻逼迁车驾幸石头，雅、超流涕步从。明年，并为贼所害。贼平，追赠
光禄勋。其后以家贫，诏赐布帛百匹。子诞，位至中军参军，早卒。
钟稚正直当官，属巨猾滔天，幼君危逼。乃崎岖寇难，契阔艰虞，匪石为心，寒松比操，贞轨皆没，亮迹双升。虽高赫在难弥恭，荀息继之以死，方之二子，曾何足云！钟刘入仕，忠贞攸履。竭其股肱，继之以死。