明
崇祯元年（1628），
魏忠贤等
伏诛，魏学濂刺血上《痛陈家难疏》，诉说父死并兄学洢殉孝状。思宗平反冤狱，追赠大中为
太常寺卿，谥忠节，予
祭葬，
魏学洢配祭
附葬，私谥孝烈。于
嘉善县城中敕建忠孝祠特祀，后又于祠前建忠臣孝子坊，里人称为魏家祠堂、魏家牌楼。
李自成逼近京师，魏学濂屡有建言，引起崇祯重视，特别召见，准备委以重任。“无何，京师陷，不能死，受贼户部司务职，颓其家声。”《
平寇志》、《
甲申朝事小纪》等，明确记载他就任
大顺“吏政府”司务，后来官方《明史》也采取了这一说法。但其降附经过，扑朔迷离，诸说竟至悬殊。一说城陷后魏学濂与
陈名夏、
吴尔埙、
方以智相遇于金水桥，大家商议以死报先帝，魏学濂反对，说：“死易尔，顾事有可为者，我不以有用之身轻一掷也。”并说出了太子等尚在，自己所联络的真定、保定义师“旦暮且至”这样的理由。后传来太子被捉并遇害的消息，而所约义师迟迟不至，于是，魏学濂赋绝命诗二首而自缢。这段叙述，毫未提及降附之事，此为“未降说”。
然而，《
明季北略》同时也录述了截然相反的说法。例如《忠逆史》：“学濂初闻贼急，有老仆经事大中（自
魏大中时即为魏家仆人），劝主人尽忠，勿负先老爷一生名节，学濂唯唯。先以事遣此仆归，遂率先
投款。初改外任，以韩霖荐，留用，授伪户政府司务。”《北回目击定案》则描述了魏学濂做“伪官”的情状：乘一头驴，“穿伪式黄袍，负一伪敕，在
草场阅刍，指挥得意。”
除上述叙事外，
彭孙贻《
平寇志》亦陈有具体经过： 学濂与山西
解元韩霖同受天主教，霖荐学濂于金星。学濂廷谒，金星曰：“汝是忠孝之家，必当录用。”引见自成，再拜曰：“小臣何能，不过早知天命有归耳。”授户政府司务，学濂南平两浙策。情节相距甚远，纷纭难定。
而《甲乙史》独有一说：甲申四月三十日丁亥，
庶常魏学濂自缢。学濂素负志节，一时堕误，知愧而死，亦愈于无颜求生者矣。亦即，既非未降，亦非降后洋洋得意，而是在纠结苦痛中自尽。
计六奇认为此说较为可信，“实为学濂定论也”。《明史》最终也采纳这一说法，“既而自惭，赋绝命词二章，缢死。去帝殉社稷时四十日矣。”
代表作有《
荷花鹭鸶图》、《芝石图》等。其名作《荷花鹭鸶图》以泼墨写出荷叶，以重墨勾筋描络，以
白描画白鹭，不加晕染却生动准确，整幅画清新明快，是一幅写意佳作。《芝石图》以灵芝为主题，兰花、山石相托。墨笔简练勾勒，大气、淡雅，寓意深远。灵芝亭亭立于崖壁之上，散发灵气。观之，仿佛可闻幽兰沁香，润人心扉。
忠孝千古事，于我只家风。一死轻鸿毛，临难须从容。有血洒微躯，官卑非侍中。有舌且存之，亦逊常山公。因约同志友，延颈受霜锋。不能张空拳，与彼争雌雄。死且有余罪，何敢言丹忠。所痛母垂白，七十仍尸饔。未葬凡五丧，留与子侄封。人谁能百年，寿夭死俱同。我比兄与弟，我年独为丰。高堂无复悲，譬不生阿侬。离母却就父，死生犹西东。体骨虽不归，即瘗此诗筒。墓木有拱时，清韵入楸松。
魏学濂，字子一。浙江嘉兴嘉善人。忠节公大中之仲子，孝子学洢弟也。忠节公遭珰祸死，学洢以身殉。
崇祯初元，公徒步入都，伏阚
讼冤，又沥血上疏，劾
阮大铖、
傅櫆交通逆奄，实杀诸贤，请论如法，天子改容恤赠有加，并抵大铖、櫆罪，公念受国厚恩，又天下多事，思以功名显，益究心天文、地理、兵农、礼乐、刑律之要，冀一旦得效驰驱，为报塞地。壬午举于乡，
癸未成进士，授庶吉士。时贼破秦晋，京师戒严，濂与同官吴尔埙、枢曹成德等，日夜涕泣，谋所以捍御策。时上日一召对，公力请东宫或二王往镇南服，又言当纠合畿辅义士，为勤王师。而编修陈名夏晓兵事，且习于山左右豪杰，宜假以事权，令出都号召。先帝韪之。会
朝议未定，而贼势日迫。公乃遣间使走容城，与孝廉
孙奇逢等，约联络勇忠赴难，计已定未报，而贼薄城下三日。城陷，公出遇
陈名夏、吴尔埙、
方以智于金水桥，且曰：我侪图一死，所以报先帝。公曰：死易尔，顾事有可为者，我不以有用之身轻一掷也。因言东宫、二王故在，而真保定间义旅，旦暮且至，独不能少忍须臾待之耶！既而东宫、二王为贼所廉得，挟之出，或传遇害于永平。先所约奇逢等，故迟迟失其期，同事者或拉之还南，公乃呜咽起立曰：昔以不死者欲以有为也。今已矣，濂义不惮一死，以报命九原。夫濂宁不知靡衣偷食之可以苟活乎？今其势非不能南，顾先帝业殉社稷，身为侍从之臣，而不获以身从，在天之灵，宁尔逭也。即不然，先父兄而有知，方谈笑俟于地下，濂所不能，以素棺白旐，祔厕先莹之侧者，又焉能冲颜腼息，重执爵而酬家庙之前也。且贼既肆为谋篡，则必将勒荐绅为朝贺，而忍复北面乎？行矣自爱，为谢故人。考叔有母，彦升有儿，固后死者责也。因为绝命诗曰：忠孝千古事，于我只家风。一死轻鸿毛，临难须从容。有血洒微躯，官卑非侍中。有舌且存之，亦逊常山公。因约同志友，延颈受霜锋。不能张空拳，与彼争雌雄。不能奉龙种，再造成奇功。死且有余罪，何敢言丹忠。所痛母垂白，七十仍尸饔。未葬凡五丧，留与子侄封。人生谁百年，寿夭死所同。我比兄与弟，我年为独丰。高堂无复悲，譬不生阿侬。辞母却就父，生死犹西东。骸骨虽不归，即瘗此诗筒。
墓木有拱时，清韵入秋松。又曰：始闻天子且出亡，继云亡后放还乡，既望义旗起四方，三者于今皆已矣。当死不死真羞惶。几家阖门自焚死。几人投缳从天子。王章不屈磔城楼，
金铉跃入御河水。街头男女不读书，西城井中何累累。耳闻眼见羡杀人，羡人不已还自嗔。死忠死孝家常事，我竟不死将谁臣。君亡国破虽易代，正统日月虚悬在。待彼篡位我死之，我死固晚免下拜。但恨有书报老亲，云儿不死休酸辛。儿今羞惶活不得，为娘爱此全归身。又贻书付子，谆谆以子孙非甲申以后生者，虽令读书，但期精通理义，不得仕宦为言。书毕自缢死。公为人豁达多大略，慷慨好义，性至孝，感忠节公诏狱之惨，终身布素，习以为常。母病几殆，为割臂肉和药以进乃瘳。谈次或及义烈事，辄为流涕，平生疾恶如仇，至不忍见。见亦不能容。居乡闭门扫轨，非公事不与闻，值荒岁倡议出粟减价平粜，赖以存活甚众。又为道殣给⺈，暑月躬至贫乏及疾者家慰问之。不以为惮也。子三，允枚、允札、允桓，皆负才英荦，无忝忠孝家风云。
★论曰：论人于死生之际，亦难矣哉。甲申之难，有欲死而即死者，范文贞、倪文正数先生。名垂日月，节炳丹青。允矣。至已死而不死者，方太史密之、龚给谏孝升、吕中翰霖生、
杨修撰静山、熊文选雪堂、陈编修百史，之数公者，君子犹当谅其志焉。若夫迟死而竟死，后先无间，忠孝同揆者，惟庶常公一人而已。假令庶常不死，则忠节精灵，骑箕乘尾，往来于霓旌霞葆间者，庶常不得追随其间，其负家乘而辱清流者，何可道也？乃好事者犹以后死为口实，善乎文学曹君尔坊之论庶常曰：结连豪杰，意在报韩。隐忍图存，冀翼
皇嗣。至必死而未死，可归而不归，
人臣处此，亦极难耳。卒以立孤勿克，感愤自经，虽不成
程婴存赵之功，庶无忝姜维复汉之节。其言切而痛矣。余故特表之，为能死者劝，而并以见吴儿好诋，舌剑唇枪，不顾人祸天刑之随其后也。
忠逆史云：学濂忠臣
魏大中子，其兄学洢事父于狱中，负尸以出，有孝名，早卒。学濂初闻贼急，有老仆经事大中，劝主人尽忠，勿负先老爷一生名节。学濂即遣仆归，遂
投款（人传学濂降贼，其母云：吾子必死难，姑待之）。
嘉兴公讨檄云：伪官魏学濂，破犁狂犊，食母逆枭，虮肝小技，繄籍名流，牛耳要盟，广招丑类。当逆闯上犯都城，痛先帝身徇社稷，阁部如范、倪、施、李等，绝脰烈于杲真，词林若刘、马、周、汪等，湛族媲乎张许。而学濂见六官之溅血，逞快云霓；听百辟之哀号，忻当鼓吹。
趋跄于晋贼韩霖之闼，鸣吠于伪相金星之阶，与吴尔埙等众议，敢言一统无疑。偕
陈名夏等授官，私喜独膺优擢。疏衔为闯父避讳，拜爵颂天命攸归。持钦授户正名刺，通谒狐群。比各门保识钱粮，效忠孽幕。于逆闯定君臣之分，于嶙然联堂属之交。合周钟、朱积之辈，庆复社之同心。对之祺、企郊之俦，羡高官之捷足。
刊修仪注，抵掌而
驰说莽巢。草定诏书，攘臂而斥言杞宋。心惭父绂，
绯衣不觉朝褫。魂绕贼廷，带玉
于焉梦锡。改名拟于子骏，图贵迫于王皮。罪深长脚，逆甚山头。彼王敦之与茂宏，尚云群从。若朱浚之溯元晦，亦第孙枝。胡遗爱复出
房乔，乃士雅竟逢
祖约。慨姬且之不作，鲜畔谁诛。使石厚之就刑，碏图莫遂。然而三纲未灭，六等犹存。
张得一之降王则，首授西曹。达奚珣之事
羯胡，腰分东市。今乱臣贼子，合为一人，即畀虎投豺，难舒众怒。所应牛五裂尸，宁止鼠十同穴。然或谱兰金，或缔姻娅，或畏其负众而不僵，或虑其党繁而复逞。缘情面之顾惜，甘狡窟之包藏。中兴伊始，法令维严。虽吴玠保川，不以曦诛连坐，而李陵降虏，须知迁腐无逃。先鸣义鼓，肃听王章。