中国农业科学院烟草研究所成立于1958年，是经国务院科学规划委员会批准、农业部筹建的国家农业专业研究机构。1959年4月经山东省人民委员会批准，正式增名“山东省烟草研究所”。1987年经国家科委、劳动人事部批准，增挂“中国烟草总公司青州烟草研究所”牌子，实行以中国农业科学院为主的三重领导体制，是中国唯一的国家级烟草农业科研事业单位。

1948年9月，山东省人民政府批准建立山东省农业试验场。占地182.5亩，职工10余人，受省农业厅领导，主要任务之一是开展烤烟种植的试验研究。

1949年5月，更名为山东省烟草改良场，隶属关系不变。

1951年1月， 易名山东省烟草试验场，属山东省农业科学研究所领导。

1952年3月，因场地过小，与益都县农场对调。

1955年4月，省农业厅决定，改建为山东省益都农业试验站，分烟草、粮食两组。

1958年春，粮食组人员迁往坊子农场。4月， 农业部下达文件组建烟草研究所。9月22日，中国农业科学院烟草研究所以山东省益都农业试验站为依托，在山东省益都县（现青州市）正式建立。

1959年4月，增名“山东省烟草研究所”。

1987年，增挂“中国烟草总公司青州烟草研究所”牌子。

2004年10月18日，经农业部、青岛市政府、中国农科院批准搬迁青岛。

2005年4月30日，经中编办批准，法人注册地点由青州变更为青岛，同时党团关系也由潍坊市转移到青岛市。

2013年10月，研究所成为中国农业科学院科技创新工程第二批试点单位。

2015年10月，经逐级推荐、专家评议，人力资源保障部、中国博士后管委会研究，批准在研究所设立博士后科研工作站。

2023年11月22日，由中国农科院烟草研究所等70余家产学研推用单位共同发起组建的青岛市农业技术协同推广联盟成立。

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所有在职职工206人，离退休人员141人。在职人员中，专业技术人员168人，45岁以下专业技术人员119人，占专业技术人员总数的71%。正高职称专家29人，副高职称专家54人，中级职称62人。具有博士学位49人，硕士学位66人，硕士以上学历占在职职工的50%以上。博士、硕士生导师51人，博士后研究人员4人。享受国务院政府特殊津贴17人，农业部有突出贡献的中青年专家2人，烟草行业学科带头人2人，中国农业科学院青年英才计划入选者2人，国家公益性行业专项首席科学家1人，中国农业科学院科技创新团队首席科学家6人。

农业部有突出贡献的中青年专家：王元英、刘洪祥

国家公益性行业专项首席科学家：王元英

烟草行业学科带头人：王元英、刘洪祥

中国农业科学院科技创新团队首席科学家：王树声、王元英、郭永峰、孔凡玉、张忠锋、王凤龙

中国农业科学院青年英才计划入选者：孔英珍等

高级专家：

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所设有8个科研部门，有农业部重点实验室2个，烟草行业重点实验室2个，中国农业科学院重点开放实验室1个，中国农业科学重点科技创新团队2个，6支所级科研创新团队。

农业部重点实验室：农业部烟草生物学与加工重点实验室、农业部烟草质量安全风险评估实验室

烟草行业重点实验室：烟草行业烟草基因资源利用重点实验室、烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室

中国农业科学院重点开放实验室：中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室

中国农业科学重点科技创新团队：

所级科研团队：烟草遗传育种科研团队、烟草功能基因组科研团队、烟草栽培与调制科研团队、烟草质量安全风险评估科研团队、烟草功能成分与综合利用研究科研团队、烟草病虫害防控科研团队

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所派出专家10余人次进行技术援外工作；派出专家学者100余人次到美国、日本、津巴布韦、匈牙利、土耳其、巴西等国进行学习考察与合作研究。邀请和接待国际著名烟草专家、学者60批200余人次来访和进行学术交流。与美国康奈尔大学、加拿大圭尔夫大学、美国园艺学研究实验室等科研机构建立了合作关系，并共建了“中加植物病虫害综合治理联合实验室”、“中美植物衰老联合实验室”，植物保健功能成分等国际合作平台正在筹建中。

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所常年有60余名专家活跃在烟叶生产技术服务的主战场。构建起覆盖中国80%烟区的技术推广和科技兴农网络，每年仅为烟农增收一项达10亿元。在山东联合开发了诸城烟草科技试验站，开展经济发达地区农业科技的相关课题研究；在四川设立了西南烟草试验基地，渗透关于经济欠发达地区的农业技术项目；在皖南设立了现代烟草农业高科技示范园。在中国17个植烟省建立了85个核心科技示范园区，开展农业高新技术的试验、中试、示范和技术创新。

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所馆藏图书、资料、期刊共60000余册（部），保存烟草种质资源5300多份，独家保存量居世界首位。

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所专用科研仪器设备1300余台（套）。有科研、实验用房（楼）等总建筑面积40000余平方米，专用科研仪器设备1300余台（套），试验用地73.6公顷。其中，青州试验基地27.6公顷，青岛试验基地31.4公顷，西昌试验基地14.6公顷。

截至2015年12月，农业部烟草生物学与加工重点实验室仪器设备总值1320万元，其中10万元以上大型仪器设备总值1044万元。农业部烟草质量安全风险评估实验室（青岛）配备有气质联用仪、液质联用仪、电感耦合等离子质谱仪等仪器设备100余台（套）。烟草行业烟草基因资源利用重点实验室有遗传分析仪、荧光定量PCR仪、高速离心机、生物倒置显微镜等仪器设备，价值1448.5万元，其中10万元以上设备40余台（套），价值1250万元。烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室有全温震荡培养箱、自动进样仪等仪器6台套，价值20万元。国家烟草改良中心有液质联用仪、ICP-MS、基因分析仪、蛋白质双向电泳仪、生物信息学分析平台、人工气候室、超速离心机、超低温冰箱、细胞 融合仪、紫外分光光度计、酶标仪、荧光定量PCR仪、凝胶扫描仪、遗传分析系统、生物显微镜、倒置生物显微镜、高效生物层析系统等仪器设备400余台 （套），价值3000余万元。

根据2016年3月研究所官网显示，1978年以来，中国农业科学院烟草研究所共取得科研成果172项，其中国家级奖13项，省部级奖75项。

截至2015年12月，中国农业科学院烟草研究所烟草行业烟草基因资源利用重点实验室承担的科研项目30项，其中国家烟草专卖局11项，省级或其它部委9项。完成并通过鉴定的科研项目16项，完成并推广的科研项目8项。国家烟草改良中心共承担国家和省部级科研项目100余项，总经费突破1亿元。

根据2016年3月研究所官网显示，1978年以来，中国农业科学院烟草研究所共出版科技专著40余部，编写教材5部，发表学术论文3000余篇。

截至2015年12月，烟草行业烟草基因资源利用重点实验室正式发表论文50余篇，SCI 8篇，国际学术交流会议上宣读4篇，在国外期刊上正式发表的科技论文5篇，参编专著4部，主持制定的国家标准2项、行业标准2项。共烟草行业烟草基因资源利用重点实验室发表论文SCI论文8篇，其中顶尖SCI期刊1篇（第二完成单位），院选核心SCI期刊2篇，累计影响因子21.576。发表国际会议论文1篇，中文论文12篇，其中EI收录1篇，院选中文核心5篇。主编著作2部，参编著作1部。国家烟草改良中心在国内外学术期刊发表论文400余篇，主编专业著作7部。青岛烟草资源与环境野外科学观测试验站育成烤烟品种8个，获得专利40余项，发表论文500余篇。

根据2016年3月研究所官网显示，1978年以来，中国农业科学院烟草研究所共育成30多个国审烟草新品种。制定、修订国家和行业标准60余项。

截至2015年12月，烟草行业烟草基因资源利用重点实验室主持制定的国家标准2项、行业标准2项。2014年，烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室研究室共获授权发明专利7项，实用新型专利1项，制定行业标准1项，软件著作权3项。国家烟草改良中心培育并通过国家审定的烟草新品种8个。青岛烟草资源与环境野外科学观测试验站育成烤烟品种8个，获得专利40余项。

原刊名称为《中国烟草》，创刊于1979年，主管单位：中华人民共和国农业部，主办单位：中国农业科学院烟草研究所、中国烟草总公司青州烟草研究所。1997年，《中国烟草》更名为《中国烟草科学》。主要辟有烟草遗传育种、栽培技术、植物保护、调制分级、生理生化、综合信息、实用技术、烟叶工业利用、专论等栏目。

期刊曾获得山东省科委评为优秀级科技期刊，被《农业与生物科学研究中心文摘》、皇家化学学会系统列文摘、中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）、中国科学引文数据库、北大2008版核心期刊、维普MARC数据、维普DC数据收录，中国国家图书馆馆藏，上海图书馆馆藏。

2015年10月，人力资源社会保障部、中国博士后管委会批准中国农业科学院烟草研究所设立博士后工作站，与中国农业科学院博士后流动站联合招收博士后。根据2016年3月研究所官网显示，研究所有一级学科4个博士学位授权点和8个二级学科硕士学位授权点，2个博士后工作站。

博士后工作站：作物学、植物保护

根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所有在籍全日制统招博士、硕士研究生110余人。从1990年至今，已培养出博、硕士研究生200余人，与高校联合培养烟草专业硕士和本科生近300人。每年统招研究生招生人数为30人。

释义：所徽设计采用 “烟草所”的三个汉语拼音首位字母（Y、C、S）变形而成。利用Y、C、S变形构成一架显微镜，表明“烟草所”的职能是从事科学研究。Y的第一笔为橘黄色烟叶变形，寓意研究所取得的丰硕科技成果和金色收获。

变形的绿色线条环绕着烟草所的三个字母，凸显了所徽的简洁与动感，绿色代表生机和活力，象征着研究所充满活力，蓬勃发展。变形而成的圆形线条，是地球的轮廓，体现了烟草所追求人与自然和谐共存的科研理念，也蕴含着烟草所的发展具有无比广阔的空间。

释义：旗帜图形是以烟草的拼音缩写字母YC、绿叶、科技环为设计元素融合而成。

字母YC笔画变形后又抽象成两片绿叶，直观突出了烟草科研机构专业的特征和特点。

绿叶也象征着绿色、环保、生机和活力，寓意着烟草研究所的快速发展和广阔前景。整体向上的造型体现着“厚积勃发、勇于探索、开创未来”的时代科研精神。

外围的科技之环，象征着烟草科研行业的不断进步，图形也蕴含着人与大自然和谐的理念。

标志造型简洁大方，主题突出，内涵丰富，易于识别和制作。

中文标准字体：方正大黑简体；英文标准字体：Arial（标准体）。

博学，笃行，创新，奉献

释义：“博学”既指广泛学习，也指学问渊博。意在引导全体职工严谨治学，博采众长，博览全书，勤奋进取，努力成长为专业精通、学识渊博、全面发展的高素质、复合型人才。

“笃行”意为专心实行，认真实践。意在倡导全体职工以脚踏实地的态度来对待工作，以严谨科学的态度来对待学术，以持之以恒的精神追求真理。不弄虚作假，不贪图虚名，求真务实，身体力行，在实践中出成果、出人才、出效益。

“创新” 就是不拘陈规，开拓进取，敢于探索。意在要求全体职工时刻保持勤于思考，敢为人先的品质和胆识，自觉培养勇于创新、善于创新的勇气和才干，不断激发创新意识，培养创新思维，为全面提升我所的自主创新能力提供不竭动力。

“奉献”是一种不求回报的给予，它既是一种高尚的情操，也是一种平凡的精神；既是中华民族的传统美德，也是人生价值的最终体现。意在期望全体职工以所为家、爱岗敬业，为科技的进步贡献力量，为事业的发展挥洒青春。