反义RNA是指与靶
RNA(多为
mRNA)具有
互补序列的RNA分子,通过与靶RNA进行
碱基配对结合的方式。参与基因的表达调控。
反义核酸是指能与特定mRNA精确互补、特异阻断其翻译的RNA或
DNA分子。利用反义核酸特异地封闭某些
基因表达,使之低表达或不表达,这种技术即为反义核酸技术1-3。它包括
反义RNA、
反义DNA和
核酶(ribozymes)三大技术。反义核酶作为一种基因下向调节作用因子,在抑制一些有害基因的表达和失控基因的过度表达上发挥着重要作用。随着反义核酶技术的发展和成熟,已逐渐应用于抗某些
人体寄生虫病的研究。
来源
反义核酸有三种来源:一是利用固相
亚磷酰胺法人工合成的短小
反义寡聚核苷酸(antisense oligodeoxyncleotides,AON),这是反义核酸最普遍的应用方式,包括未修饰AON和硫代磷酸酯化(
PS)、磷酸二酯化(PO)和甲基化等修饰AON二类,其中以
PSAON应用最广泛。ANO设计合成简单,只要其顺序与靶mRNA部分顺序互补即可,而对基因的
读码框无要求;二是更具有实用价值的人工表达载体,包括单个基因和多个基因的联合反义表达载体[3],它是利用
基因重组技术将靶基因序列
反向插入到载体的启动子和
终止子之间,通过转录可源源不断产生反义RNA分子;三是天然存在的反义核酸分子,但
分离纯化尚存在困难。
分类
反义RNA是指能和
mRNA完全互补的一段
小分子RNA或
寡聚核苷酸片段,
反义DNA是指能与基因DNA
双链中的
有义链互补结合的短小
DNA分子。反义RNA和反义DNA主要是通过mRNA的翻译和基因DNA的转录而发挥作用[10]:(1)抑制翻译。反义核酸一方面通过与靶mRNA结合形成
空间位阻效应,阻止
核糖体与mRNA结合,另一方面其与mRNA结合后激活
内源性RNase或
ribozyme,降解mRNA[3];(2)抑制转录。反义DNA与基因
DNA双螺旋的
调控区特异结合形成DNA
三聚体(triplex),或与DNA编码区结合,终止正在转录的mRNA链延长[3]。此外,反义核酸还可抑制转录后mRNA的加工修饰,如5'端
加帽、3'端
加尾(poly a)、中间剪接和内部
碱基甲基化等,并阻止成熟mRNA由
细胞核向细胞浆内运输。
核酶
Cech等发现
四膜虫核糖体RNA前体在成熟过程中,可精确地自我切除某些片段并重新连接,这种具有
酶催化活性的
RNA称之为
核酶[11,12]。
核酶广泛存在于
生物细胞中,有锤头状和
发夹二种结构。
酶活性中心由两个臂和中间的功能区组成[13]。两个臂序列高度保守,与靶RNA特异互补结合,相当于一种
反义RNA,而功能区则可通过降解RNA的
磷酸二酯键而分解消化靶RNA,而核酶本身在作用过程中并不消耗。核酶裂解分子依赖严格的
空间结构形成,裂解部位总是位于靶RNA分子中GUX三联体(X:C、U、A)下游方向即3'端[12]。
核酶除天然存在外,也可人工合成。根据核酶的作用位点、靶mRNA周围的序列和核酶本身
高度保守序列,可方便地人工设计合成核酶的特异性序列。此外,利用
基因工程将核酶的编码
基因克隆在SP6或T7等
启动子下游,通过转录合所需核酶。核酶能特异切割RNAA分子,使阻断
基因表达,特别是阻断有害基因的表达成为可能。如果已知靶mRNA中GUX三联体的位置,可将核酶的编码基因插入
反义表达载体的适当位置,这样转录所产生的含有核酶的反义RNA具有双重功能:一方面具有反义抑制作用,另一方面具有切割靶mRNA的
催化作用。核酶在抗
肿瘤、
抗病毒方面具有十分诱人的前景,第一个应用核酶进行
艾滋病基因治疗的临床计划已获准,核酶作为一种
遗传信息药物,在肿瘤基因治疗中必将日益受到重视。
特点
反义核酸作为基因治疗药物之一,与传统药物相比具有诸多优点。(1)高度特异性:反义核酸药物通过特异的
碱基互补配对作用于靶RNA或
DNA,犹如“
生物导弹”。(2)高
生物活性、丰富的
信息量;反义核酸是一种携带特定遗传信息的
信息体,碱基排列顺序可千变万化,不可穷尽。(3)高效性:直接阻止疾病基因的转录和翻译。(4)最优化的
药物设计:反义核酸技术从本质上是应用基因的天然顺序信息,实际上是最合理的药物设计。(5)低毒、安全:反义核酸尚未发现其有显著毒性,尽管其在生物体内的
存留时间有长有短,但最终都将被降解消除,这避免了如转基因疗法中
外源基因整合到宿主染色体上的危险性。
应用
反义核酸技术的飞速发展和成熟,使其逐渐渗透并应用到
寄生虫学领域,丰富和发展了
寄生虫病的
基因治疗策略。反义核酸技术在抗寄生
虫病研究的应用主要集中于
原虫类,如
疟原虫、
锥虫和
利什曼原虫等,而且反义核酸中又以AON方面的报道最多。下面着重就AON在寄生虫方面的研究应用作用一简要阐述。
⒊1 疟原虫
疟原虫
嘌呤核苷酸合成具有特殊性,即无从头合成途径,依靠
补救合成途径利用体内游离的
嘌呤或
嘌呤核苷。疟原虫的
二氢叶酸还原酶(dihydrofolate reductase,DHFR)和
胸苷酸合酶(thymidylate synthase,TS)结合形成双
功能蛋白(DHFR-TS),这对于维持疟原虫
四氢叶酸水平和
DNA合成极为重要[14],此酶也是疟原虫
脱氧胸苷酸生物合成通路中必不可少的酶。
抗疟药中的抗
叶酸代谢药如
乙胺嘧啶,就是通过
竞争性抑制DHFR-TS来阻断虫体脱氧胸苷酸生物合成[15]。然而,随着
恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)多药抗性株的出现和广为传播,
疟疾的
化疗面临重大挑战,促使人们寻求新的抗疟疗法。DHFR-TS是AON抗疟作用首选
靶基因。
生物
大分子进入感染
红细胞中的疟原虫,必需穿透三层膜,即
红细胞膜、纳虫泡膜和虫体的
胞质膜。研究表明,不能穿透红细胞膜和纳虫泡膜的大分子和
葡聚糖、IgG2a抗体和
蛋白A等,可经过纳虫
微管(parasitophorous duct)进入虫体,虫体通过
胞吞作用直接从细胞外摄入
大分子物质[16]。因此,对于
小分子的AON而言,作用于感染红细胞中的虫体完全成为可能,下述众多研究已充分证明了这一点。Rapaport等(1992)研究发现[17],以DHFR-TS为靶21 nt PS AON能选择性地进入恶性疟原虫感染红细胞,对体外培养的
氯喹敏感株和耐药株虫体具有同等的抑制效果,而未感染疟原虫的红细胞则完全为不摄入AON,因此这对应用反义核酸于抗疟治疗非常有利。
诸多研究表明,AON越长,对转译的
抑制作用就越强;AON浓度越高,非
特异性抑制作用越明显,在低浓度时则呈特异性抑制。Sartorius和Franklin(1991)以DHFR-TS的
mRNA为靶合成系列AON,利用兔
网织红细胞翻译系统,探讨AON对体外转译的抑制作用[18]。在DHFR
翻译起始位点处合成了6条21-49nt不等长的AON,在TS编码区全成的30nt、39nt和49nt三条AON。当AON长度为30nt或更长时,呈明显转译抑制作用,抑制率可高达50%以上。其中,TS编码区的49nt aON(OTS49)抑制效果最高,当浓度在45μmlo/L时的抑制率几乎达90%,主要是因为OTS49与DHFR-TS靶mRNA