基因工程
教育部重点实验室是成立于2000年8月，以
中山大学生物工程研究中心与植物基因工程国家专业实验室为依托，2005年10月通过验收，2010年9月25日顺利通过现场评估。实验室现共拥有实验室3000多平方米，温室、网室200多平方米，仪器设备1300多件（套），总值2500多万元。另有
中山大学生命科学学院可共享使用的公用设备120多件（套），价值5000多万元。
现任实验室学术委员会主任
孔祥复院士，实验室主任
屈良鹄教授，副主任
陈月琴教授。实验室现有固定科研人员31人，其中教授13人，副教授 9人，国家杰出青年基金获得者4人。实验室先后组建了以屈良鹄教授为学术带头人的“RNA科学与技术”和以庄诗美教授为学术带头人的“肿瘤分子生物学”两个特聘教授研究团队。科研队伍中既有从事生物化学与分子生物学、遗传学、细胞生物学、微生物学的专家，又有从事农学和医学等方面的专家，是一支充满朝气与活力的高层次科研队伍。实验室作为中山大学生命科学学院
有害生物控制与资源利用国家重点实验室和生物化学与分子生物学国家重点学科的主要支撑基地之一，承担了遗传学、生物化学与分子生物学学科本科生和研究生的教学任务。开设遗传学、细胞生物学、植物分子生物学、
功能基因组学、分子生物学等主要课程。已培养硕士生、博士生和博士后400多人。
实验室先后主持承担了一大批国家、省部级重点项目。2005年以来承担的主要项目有“973” 首席科学家项目2项（首席科学家屈良鹄教授、徐安龙教授），“973”子项目2项，“863”高科技项目6项，
国家杰出青年科学基金项目5项（含B类），
国家自然科学基金项目46项，以及省部级等共160多项，科研经费8000多万元。实验室具有强大的技术创新和知识创新能力。近年来在功能
RNA组学、动植物基因工程、基因工程新药物、中药现代化研究、人类疾病的分子基础、新的基因资源开发和利用、酶化学与酶工程、生物防治与环境保护的分子生物学等理论与应用方面取得了一系列重要成果。其中屈良鹄教授学术团队的“新的snoRNA结构与功能研究”获2007年度
国家自然科学奖二等奖；李宝健教授（为第二单位）与省农科院合作的“黑色食品作物种质资源研究与新品种选育及产业化利用”获2008年度国家科技进步奖二等奖。此外，还获得省部级科学奖一等奖5项;获得国家专利60多项；出版专著11部；发表论文400多篇，其中SCI论文为80%，已有多篇论文发表在《Nature Medicine》、《SCIENCE》、《Systematic Biology》、《PNAS》和《Hepatology》等国际著名刊物上。
2010年9月25日,由
段树民院士（浙大）任组长，
王晓民（
首都医科大学）、
罗跃嘉（北师大），陈军（四军大），
顾晓松（南通大学）教授，以及教育部领导池颖等人组员组成的教育部评估专家组莅临我校对“基因工程教育部重点实验室”进行了现场评估。当天上午，评估学术报告会在生命科学学院
贺丹青堂会议室举行。我校副校长
许宁生院士到会向各位专家致辞表示欢迎和感谢，并诚挚希望各位专家为“基因工程教育部重点实验室”的建设提出宝贵意见。出席本次报告会的还有校科技处董美玲副处长，生命科学学院党委书记武少新，院常务副院长束文圣教授，副院长冯双副教授。“基因工程教育部重点实验室”的全体老师也参加了会议。
“基因工程教育部重点实验室”主任
屈良鹄教授向专家组作了“基因工程教育部重点实验室工作报告”。他向专家组介绍了实验室自2005年以来实验室的总体目标、研究方向、科研团队和取得的科研、教学成绩，以及人才培养、运行管理机制等有关情况。并提出了实验室的中长期工作的设想。随后邵鹏博士，陈月琴、庄诗美、施苏华、刘建忠教授分别代表所在的研究团队作了代表性成果的学术报告。专家组通过听取实验室的工作报告、代表性成果学术报告。现场考察实验室，与骨干教师、青年教师访谈，并查阅所提交的科研项目与经费、发表的论文、申请的专利，获得的奖励，学术交流与人才培养及有关管理的相关证明资料后，专家组对实验室的评估反馈了意见。
专家组认为：基因工程教育部重点实验室自2000年立项，2005年通过验收之后，一直立足华南以及全国重大社会需求，瞄准国际学科前沿，在基因资源、重要农作物育种、人类某些重大疾病的相关基因调控、微生物与药物基因工程的方面开展研究。建立了RNA组学、植物基因工程、医药基因工程研究平台。实验室在科研与技术创新、人才队伍建设和学术交流等方面都取得了长足进展。在建设期内，实验室通过培养、引进和留用一批优秀的中青年学术骨干，逐步形成了一支梯队年龄结构合理、学历层次高、专业覆盖面广、技术力量雄厚的科研队伍。共有教授14人，院士1人，其中国家杰青基金获得者4人，国家级教学名师1人。副教授9人。共承担国家、省（部、委）级项目共155项，其中承担科技部“973”等国家重点、重大项目9项，“863”计划项目6项，国家杰出青年基金项目1项，
国家自然科学基金重点项目4项，国家自然科学基金面上项目41项，总经费7239万元，到位4579万元。获得省部级以上奖状7项,其中包括国家自然科学奖二等奖,国家教学成果二等奖，教育部自然科学奖一等奖，广东省科学技术奖一等奖和广东省高等教育教学成果一等奖。发表论文307篇，其中在《Science》、《Nature Medicine》等杂志上发表SCI论文250篇，SCI影响因子783.3。出版专著3部，参编5部。获专利52项(授权45项)。研究工作成绩显著,某些方向成果达到国际先进水平，其中
非编码RNA的研究达到国际领先水平。