官田区旧称“官佃”。荷治时期，此地属于“王田”，即政府田地。
明郑时期改王田为“官田”，将土地交由文武百官招募佃农屯垦，其中以
陈永华一族承佃最多，逐渐形成汉人聚落，故称“官佃”。
清领时期此地属“官佃庄”，日治时代
1920年改称为“官田庄”，属
台南州曾文郡管辖，庄役场位于官田（后之官田村）。战后改为
台南县官田乡，
1953年将乡治由官田村迁往隆田村（旧名番子田）。
2010年12月25日改称官田区。
官田区较之其他
行政区的独特之处，在于其难得地拥有丰厚的史前文化，在三千年前即有人类活动的区域，却是近一百年才于日治时代确立了今日官田区的疆域。官田区的区政虽年轻，人民与土地的历史却可溯源甚古。
官田区位于
台南市中央偏北地点，曾文区之东；以
曾文溪为界，东连
中央山脉。
中央山脉使得背风的
嘉南平原在入冬以后，难得雨水滋润。为使农耕免于看天田的困境，官田区和邻近行政区遂开凿池埤蓄水备用，成为台地湖沼最密集的地方，除大大小小的池埤，最有名的是
乌山头水库、统领埤、蕃子田埤等。
本区土地面积7,79公顷，占全县总面积3.5%，其中农耕地面积有385.535公顷，山坡地面积有1,38公顷。主要产业为
农业，农产有稻米、甘蔗、瓜果、蔬菜，特产为菱角、芒果。畜牧有乳牛、鸡、猪。