落马洲站是港铁东铁线的其中一个始末站，也是两铁合并前九广东铁最后一个启用的车站，为高架站。位于中华人民共和国香港特别行政区新界元朗区落马洲一带，于2007年8月15日下午4时启用。

港铁落马洲站是香港港铁（原地铁）东铁线（两铁合并称九广东铁）落马洲支线的始末站。位于新界元朗区落马洲一带，已经在2007年8月15日下午4点启用。这个车站的目的是疏导罗湖站过境人流。

行驶落马洲支线的列车从起点站大部分在金钟站，然后经过多个站点后，不行驶罗湖主线，到上水站后直接行驶落马洲支线到落马洲站。通车初期，东铁线在繁忙和非繁忙时间每小时分别有6班和5班列车以落马洲站为终点站。

乘客可于过关后在福田口岸站接驳深圳地铁4号线或深圳地铁10号线。

落马洲站是两铁合并前九广东铁最后一个开通的车站，由卢纬伦建筑师事务所设计，服务东铁线沿线前往内地的乘客，兴建车站的目的为疏导罗湖站的过境人流车站，并于2007年8月15日下午4时启用。

因为福田口岸的通关时间所限，本站是港铁中列车服务时间最短的车站。

落马洲站设有4层，占地约9公顷，地面为公共运输交汇处（有的士站、小巴站及巴士站）。车站内升降机以T代表票务大堂（Ticketing）、A代表抵港大堂（Arrival）、P代表月台（Platform）、D代表离港大堂（Departure）。车站外升降机则使用G、L1、L2及L3。另外，同层的月台及抵港大堂不相通，必须乘坐扶手电梯经车站大堂才能抵达公共运输交汇处。

A- 联检大楼（福田口岸）

只限持有有效旅游证件者使用

落马洲口岸出境大堂、福田口岸、深圳地铁4号线、深圳地铁10号线 福田口岸站（两站需出站换乘）

B - 下湾村（香港境内）

只限持有有效旅游证件并乘搭九龙巴士B1线，新界专线小巴75线，乘坐香港出租车的乘客使用

持有有效禁区通行证的香港居民使用

下湾村、落马洲站公共运输交汇处（落马洲铁路站公交车站/的士站/小巴站）

落马洲站只分为三个主要大堂，包括离港大堂、抵港大堂及车站大堂。为方便人流管控，乘客不能直接由离港大堂前往抵港大堂或车站大堂，当乘客到达离港大堂后，不可以返回月台，必须出闸前往深圳或出口。

由于落马洲站为出入境检查站，所以在离港大堂、抵港大堂设有海关、出入境及其他重要的过境设施。乘客办妥出境手续后，将会经由一条横跨深圳河的单臂斜拉式天桥步行至深圳市的福田口岸联检大楼。待过关后，可步行至1层福田口岸站，转乘深圳地铁4号线或深圳地铁10号线前往其他地方。

另一方面，落马洲站的票务大堂内设置两部湿地观赏仪，可供乘客利用仪器欣赏落马洲邻近一带的天然湿地环境。

车站商店及自助服务

大堂设有购物区，入面有车站商店、餐厅、免税店、医务中心、自动柜员机等方便乘客。

落马洲站设有2个月台，位于L2层，采用岛式月台排列，方便乘客乘坐往金钟站方向的东铁线列车。

落马洲站原先设计只供东铁线的过境乘客使用，但在多名立法会议员大力争取打破九广铁路垄断过境交通的压力下，政府终于让步，准许专营巴士、专线小巴及的士接载乘客往来落马洲站，并于2007年初邀请招标1条来往元朗东至落马洲站的专营巴士线（九龙巴士B1线 天慈→落马洲站），以及公开招标一条来往元朗市中心的绿色专线小巴线75线（元朗福康街→落马洲站）。市区及新界的士亦可直接驶入该交汇处载客。

过境旅客可以乘搭公共交通工具于落马洲站公共运输交汇处下车，然后直入落马洲站的出境大堂过境，相反亦然。但此安排曾引起车站保安的争议，因为车站最初设计没有预料到会有人流从其他途径进入车站。

新界专线小巴75号线（元朗福康街至落马洲站）在落马洲站通车后延长至该处，收费加至港币7元。九巴亦于当日开办B1线，由元朗站经新田公路往来该处（现已改为天慈→落马洲站），全程收费港元11.60元（成人），设有现金双向分段港元10.50元及即日来回证优惠。另外路线开办初期将提供全程10元及分段9元票价优惠，并设即日来回特别优惠。由2008年6月22日起，B1路线延长至天慈，途经元朗中心区及天水围。

深圳境内

1.深圳地铁4号线

2.深圳地铁10号线

福田口岸站（需出站换乘）

1.九巴B1线 天慈↔落马洲站

深圳境内

1.26路 福田口岸公交总站-桃源村总站

2.362路 福田口岸公交总站-燕罗塘下涌综合场站

3.B905路 福田口岸公交总站-三号隧道口-福田口岸公交总站（单环线）

5.B957路 石厦南总站-福田口岸公交总站-石厦南总站（单环线）

6.M499路 梅林一村总站-福田口岸公交总站

7.B685路 福田口岸公交总站-下沙总站

香港境内

新界绿色车顶专线小巴75线 - 元朗（福康街） ↔ 落马洲站

前九广铁路公司主席田北辰估计，落马洲支线首年客量平均可达每日6万人次。前东铁客运总经理黎守谦表示，通车首日（2007年8月15日，只服务了6.5小时左右）约有1万人次使用落马洲站。 而据香港入境处的数据显示，连同东铁、巴士、小巴及的士在内，通车翌日（2007年8月16日，即首次全日服务）共有25,276名旅客采用落马洲支线口岸过境。另外，根据星岛日报报道，2007年8月15日至18日的落马洲支线乘客量为1万、2万、2万1千及3万1千。

由于使用当时的九广东铁前往落马洲站的客量持续偏低，因此在2007年11月4日起推出“落马洲周票”试验计划。由逢星期日起计，每星期可从各东铁线车站（不包括马鞍山线及罗湖站）乘搭东铁线往来落马洲站12次，票价为港币240元正。试验计划曾多次延长，最后于2008年7月26日结束。

落马洲站本来是西铁延伸出来的北环线的其中一个终点站，但最后改为东铁延伸出来的落马洲支线的终点站。随落马洲支线于2003年1月动工兴建，并于2005年4月19日举行落马洲站封顶典礼，主礼嘉宾包括环境运输及工务局常任秘书长罗智光、九铁主席田北辰、九铁署理行政总裁黎文熹及九铁新铁路工程高级总监李镜权等。落马洲站原定于2007年7月1日通车，但因为内地方面的福田口岸有待检收，延迟至8月15日才正式通车。首班由尖东开往落马洲站的列车在当日下午3时15分开出，而首班南行列车亦在下午4时15分由落马洲站开往尖东（现已改为金钟）。

计划中的北环线将由屯马线锦上路站出发，经洲头站，以落马洲站为终点站。如果落实，落马洲站便会成为北环线和东铁线的其中一个转车站（落马洲站、洲头站），北环线将成为通往落马洲铁路口岸的第二条铁路，但将不会加建新的月台，乘客可在落马洲站跨月台转乘北环线或东铁线。

北环线规划由锦上路站出发经凹头站，牛潭尾站，新田站，以落马洲支线上的古洞站为终点站