慢性菌痢主要病理变化是结肠溃疡性病变，溃疡边缘可有息肉形成，溃疡愈合后留有瘢痕，导致肠狭窄，若瘢痕正在肠腺开口处，可阻塞肠腺,导致囊肿形成,其中贮存的病原菌可因囊肿破裂而间歇排出。菌痢病情迁延不愈超过2个月以上者称作慢性菌痢。慢性菌痢多由于轻型病例未能诊治，一般病例治疗不及时或不合理造成，也有因菌耐药，虽经正规治疗仍转为慢性者。凡有营养不良，胃酸低，慢性胆囊炎，肠道寄生虫病者易形成慢性；神经稳定性失常，饮食失常，受凉或过度劳累则是导致慢性或缓解期转为急性发作的诱因。

慢性菌痢，有持续轻重不等的腹痛、腹泻、里急后重，排粘液脓血便的痢疾症状，病程超过两个月。

菌痢病情迁延不愈超过2个月以上者称作慢性菌痢，多与急性期治疗不及时或不彻底，细菌耐药或机体抵抗力下降有关，也常因饮食不当、受凉、过劳或精神因素等诱发。依据临床表现慢性菌痢的症状分为以下三型：

（1）急性发作型此型约占5%，其主要临床表现同急性典型菌痢，但程度轻，恢复不完全，一般是半年内有痢疾病史或复发史，而除外同群痢菌再感染，或异群痢菌或其它致腹泻细菌的感染。

（2）迁延型发生率约10%，常有腹部不适或隐痛，腹胀、腹泻、粘脓血便等消化道症状时轻时重，迁延不愈，亦可腹泻与便泌交替出现，病程久之可有失眠、多梦、健忘等神经衰弱症状，以及乏力、消瘦、食欲下降、贫血等表现。左下腹压痛，可扪及乙状结肠，呈条索状。

（3）隐慝型此型发生率约2~3%，一年内有菌痢史，临床症状消失2个月以上，但粪培养可检出痢菌，乙状结肠镜检查可见肠粘膜病变。此型在流行病学上具有重要意义。

（1）寻找诱因，对症处置。避免过度劳累，勿使腹部受凉，勿食生冷饮食。体质虚弱者应及时使用免疫增强剂。当出现肠道菌群失衡时，切忌滥用抗菌药物，立即停止耐药抗菌药物使用。改用酶生或乳酸杆菌，以利肠道厌氧菌生长。加用B族维生素、维生素C、叶酸等，或者口服左旋咪唑，或肌注转移因子等免疫调节剂，以加强疗效。

（2）对于肠道粘膜病变经久未愈者，同时采用保留灌肠疗法，可用1～5000呋喃西林液150ml，或加氢化可地松100mg，或5～10%大蒜溶液150ml加强地松20mg及0.25%普鲁卡因10ml，保留灌肠，每晚一次，10～14日为一疗程。

1、直肠、结肠癌：中年以后发病率较高，病情顽固，抗菌剂疗效不佳，全身状况差并且呈进行性。一般来讲，对慢性患者，均应尽早肛检或内窥镜检。

2、 肠结核：常呈腹泻与便秘交替，多有午后低热，盗汗，消瘦等一般结核病中毒等症状，腹痛多在右下腹，可扪及包块，血沉增速，X线钡剂、内窥镜检以及抗痨治疗有助诊断。

3、非特异性溃疡性结肠炎：病程较长，内窥镜可视肠粘膜充血、水肿及溃疡形成，粘膜松脆易于出血，抗菌剂治疗多无效，需用皮质激素与免疫抑制剂。血清中有对肠粘膜上皮细胞的脂多糖抗体。

血象：急性期白细胞总数多增高，常在10-20×109/L之间，中性粒细胞百分比也显著增高。慢性病人红细胞及血色素常有减少。 　粪便检查：急性期典型患者的粪便量少，有脓血，粘液，无粪质。显微镜下有大量脓细胞、红细胞与巨噬细胞有诊断价值。粪便培养阳性是确立诊断的依据。为取得阳性结果，应在用抗菌素之前选取大便的脓血或粘液部分作培养。标本必须新鲜，如搁置3~4小时或与尿混合，将影响结果。取肛拭作床边培养效果较好。

X线钡剂检查：慢性期可见肠道痉挛，动力改变，袋形消失，肠腔狭窄，肠粘膜增厚，肠段收短，或呈节段状病变如香肠样。

一、忌肉类浓汁及动物内脏。因其含有大量的含氮浸出物，如嘌呤碱和氨基酸等。含氮浸出物具有刺激胃液分泌作用，汁越浓作用越强，加重了消化道负担。而且细菌性痢疾病人肠道有病变，有恶心呕吐等症，消化吸收更差。

二、忌粗纤维、胀气食物。如芥菜、芹菜、韭菜等纤维粗而多的食物，不易消化，导致局部充血、水肿，炎症不易愈合。而牛奶和糖、豆制品也易引起肠道蠕动增加，导致胀气。

三、忌刺激类食物。如煎、炸及腌、熏的大块鱼肉，对肠壁有直接刺激，使肠壁损伤加剧;这些食物又难以消化，胀气发热，停留的时间长，会加重消化道负担。

四、忌污染食物。未经消毒的瓜果蔬菜，这些既带菌又易引起中毒，是致病因素，并使病人抵抗力下降。

五、忌性寒滑肠食物。如荸荠、甲鱼、生梨、花生等物，性寒伤脾胃，易滑肠致泻，故忌用。

六、忌辛热刺激食物、韭菜、羊肉、辣椒、鲜辣椒粉和浓茶、酒、各种咖啡饮料，都是强烈的刺激品，致血管痉挛收缩，使粘膜充血、水肿、破损，故忌用。

另外，在恢复好转期间的患者，由于肠胃较弱，仍应禁食生冷、坚硬、寒凉、滑腻之物，如凉拌蔬菜、豆类、冷饮、酒类、瓜果等。