朱一贵于康熙五十二年（1713年）渡台，居
凤山罗汉内门（今
高雄市内门区）。朱一贵侠义好客，豪放健谈。每有客至，他就宰鸭煮酒，述及国事政情，或崇论宏议，或悲伤感叹。
康熙六十年（1721年），
凤山县知县出缺，暂由知府
王珍兼理，王珍把知县职务交由他儿子管理，但王珍的儿子利用职权横征暴敛，向百姓无休止摊派各种苛捐杂税，怨声四起。恰巧这时
台湾地震引起海水泛涨，民间
谢神官种朱一贵对
清政府的压迫剥削早怀不满。三月十五日，他与友人黄殿、颜子京、李勇、吴外等十六人聚会拜把，决定
武装起义大元帅鸟枪、
藤牌十数件。接着又攻占新园汛、南路营、诸罗山、埤头汛、滨榔林汛、下淡水汛等营汛，夺取了武器。
叛军队伍迅速壮大，到四月下旬有二万多人，五月上旬又有数万人加入叛军。到最高峰时，参加叛乱人数达三十万人。响应者有许多是郑家当政时期的
将校武官，因此有些战斗力，再加上台湾总兵
欧阳凯不得人心，被
把总杨泰立背后偷袭刺杀。清军失去了主心骨顿时大乱，一路溃逃，一直逃到
澎湖。叛军则先后收复了
凤山县、
台湾府、
诸罗县。五月初又收复了
府治（今
台南市）。清军守备胡忠义、千总蒋子龙、把总林彦、石琳战死。台厦巡道梁文渲、知府
王珍、同知王礼及县丞、知县、
典史剃发令，脱下
旗装、剪断长辫，祭祀天地列祖列宗及延平武王朱成功。同时大封诸将四十余人；随后发布文告，号令天下。
台湾起义的消息传到清廷，
闽浙总督满保兼程赶赴
厦门，调南澳总兵
蓝廷珍出师讨伐。
水师提督施世骠也速奔澎湖。当清军调兵遣将之时，叛军内土豪出身的杜君英、杜会三父子因图谋王位不成而作乱，虽没成功但带着部下几万人出走，叛军力量因此被削弱。
六月十六日，清军在
鹿耳门登岸，打败当地的叛军。二十一日，
台湾府城被清军占领。叛军准备退守诸罗，又遭蓝廷珍伏兵袭击。朱一贵率部退驻下前，再退沟尾庄。
七月初六，朱一贵被部下杨旭、杨雄出卖，清军抓获了他。十二月十八日，朱一贵和其它叛军首领一起被押送到北京凌迟。朱一贵被俘后，叛军或散或逃或继续抗清，直到雍正元年（1723年）台湾才复归平静。而出走的杜君英、杜会三父子等人最终也被清军捕杀。
朱一贵起义统治阶级和
人民群众的矛盾已发展到十分尖锐的地步，所以朱一贵揭竿而起，能够一呼百应。它对后来
蓝廷珍、
蓝鼎元提出一系列治理和开拓台湾，促进台湾社会安定和发展的措施，却起了不可小视的警示作用。
民间传说朱一贵死后被玉皇大帝封为“台南州城隍绥靖侯”，在台南市小南门
城隍庙被祀为主神。据说朱一贵养鸭于鸭母寮，于今
高雄县内门乡光兴村内。鸭母寮兴安宫供奉朱一贵神位，兴安宫在庙前水池中增置朱一贵赶鸭子的塑像。
在昔胡元猾夏，窃号神州，秽德彰闻，毒逋四海。我太祖高皇帝提剑而起，群士景从，以恢复区宇，日月重光，传之万夕。逆闯不道，弄兵潢池，震动京师，帝、后殉国。地坼天崩，椎心泣血。东南忠义再造邦基，秣马厉兵，方谋讨贼。何图建虏，乘隙而入，藉言仗义，肆其穷凶。窃据我都邑，奴僇我人民，颠覆我邦家，殄灭我制度。长蛇封豕，搏噬无遗。
遂使神明胄子，降为舆台；锦绣江山，沦于左衽。乌乎痛哉！
延平郡王精忠大义，应运而生，开府思明，经略闽粤。旌旗所指，喋血关河，使彼建虏，疲于奔命。则有熊罴之士，不二心之臣，戮力同仇，效命宗国。南京之役，大勋未集，移师东下，用启台湾。率我先民，以造新邑，遥奉
正朔，永戴
本朝。蓄锐养精，俟时而动。虽张坚之王扶余、田横之居海岛，
史策所载，犹未若斯之烈也。天未厌祸，大星遽殒，兴王之气，猝尔销沉。然东都片壤，犹足以抗衡海上焉。嗣王冲幼，辅政非人，大厦将倾，一木难柱。以故权奸窃柄，偷事宴安，叛将称戈，甘为罪首。沧海横流，载胥及溺，茫茫九州，无复我子孙托足之所矣。哀哉！
夫盛衰者时也，强弱者势也，成败者人也，兴亡者天也。古人有言，炎炎之火，可焚昆冈。是以
夏后一成，能复故国，楚人三户，足以亡秦；况以中国之大，人民之众，忠臣义士之眷怀本朝，而谓不足以诛建虏者乎？不佞世受国恩，痛心异族。窜逃荒谷，莫敢自遑。伫苦停辛，垂四十载。今天启其衷，人思其旧，揆时度势，否极泰来。爰举义旗，为天下倡。群贤霞蔚，多士云兴；一鼓功成，克有全土。此则列圣在天之灵实式以凭，而中兴之运可操左券也。
夫台湾虽小，固延郡平王肇造之土也。绝长补短，犹方千里。重以山河之固、风涛之险、物产之饶、甲兵之足，进则可以克敌，退则可以自存。博我皇道，宏我汉京，此其时矣。唯是新邦初建，庶事待兴，引企英豪，同襄治理。然后奖帅三军，横渡大海，会师北伐，饮马长城；捣彼
虏庭，歼其丑类，使胡元之辙，复见于今，斯为快尔。所望江东耆艾、河朔健儿，岭表孤忠，中原旧曲，各整
义师，以匡诸夏。则
齐桓攘夷之业，晋文勤王之劳，赫赫宗盟，于今为烈。其或甘心事敌，以抗颜行、斧钺之诛，罪在不赦。夫非常之原，黎民所惧，救国之志，人有同心。敢布区区，咸知大义。
二三君子，尚克图之。