第五马其顿军团（英语：Legio V Macedonica）古罗马军队建制名称。由盖乌斯·维比乌斯·潘撒·凯特洛尼亚努斯和屋大维于公元前43年所建立。

这个军团是在公元前43年由执政官盖乌斯·庞萨和屋大维组建的。这个军团的标志是一头公牛。是历史上最长寿的罗马军团。第五马其顿军团可能参加了亚克兴角海战，公元前15/14年，马其顿军团的退役士兵与第八奥古斯塔军团的退役士兵一起定居在Berytus（现代的贝鲁特）

公元前30年至公元前6年期间，第五军团在马其顿服役，也就是这个时候，第五军团得到了自己的名字——马其顿

在公元6年，军团调到了默西亚的Oescus（现保加利亚吉根），在那里军团将一直驻扎到公元61年，守卫下多瑙河边境以对抗达契亚部落。公元62年，第五马其顿军团被调往东方，驻扎在黑海以南的本都。

第五马其顿军团仍然驻扎东方，当时对犹太人的战争爆发（公元66年），军团被未来的皇帝韦帕芗指挥。第五马其顿军团与第十海峡军团和第十五阿波罗军团一起，活跃在加利利地区，在公元67年攻下了塞佛瑞斯。在接下来的几年里，罗马人慢慢地转移到了南方。第五马其顿军团最显著的功绩之一是攻占了撒马利亚人的圣所基利心山。公元68年，战争终止了，因为尼禄皇帝自杀了。军团在以马忤斯待了一段时间。而后提图斯在公元70年继续作战，占领了耶路撒冷。罗马胜利后，第五马其顿军团护送提图斯到亚历山大港，然后返回默西亚。第五马其顿军团离家已经近十年了。

公元88年，一支罗马大军入侵达契亚，第五马其顿军团是参与其中的九个军团之一。

此时军团的一名军官是未来的皇帝——哈德良。后来，第五马其顿军团参加了图拉真对抗达契亚人的战争（公元101-106年），随后第五马其顿军团在公元107年被调往多瑙河三角洲附近的 Troesmis （现代的Iglita）。在这里，第五马其顿军团面对着罗科索拉尼人。

而后哈德良将第五马其顿军团调往犹太行省，以平息巴尔科赫巴起义。

公元160年代，第五马其顿军团跟随维鲁斯皇帝对帕提亚帝国发动了战争。当第五马其顿军团从东方归来后，就驻扎在现在的图尔达。在康茂德统治早期，奈哲尔和阿尔拜努斯指挥第五马其顿军团和第十三合组军团，打败了萨尔马提亚人。当这场战争结束后，罗马人把注意力转向了达契亚人。达契亚人用金矿雇佣了一支雇佣军。不过这支雇佣军被第五马其顿军团击败了，康茂德皇帝在公元185年或者是公元187年授予第五马其顿军团“Pia Constans”（“忠诚可靠”）的头衔

在三世纪的大部分时间里，第五马其顿军团在图尔达参加了多次战斗，赢得了很多荣誉。

公元274年奥勒良皇帝放弃达契亚后，军团又回到了默西亚，这里第三次成为第五马其顿军团的驻地，后来第五马其顿军团中的骑兵分队被戴克里先皇帝从军团中抽走组建成为了新的部队。

第五马其顿军团的一些单位在公元400年出现在了叙利亚地区，不过军团主体仍然留在默西亚地区，此时的军团已经是东罗马帝国的军队了

有文献表明在公元637年阿拉伯人征服埃及之前，第五马其顿军团至少还有一部分驻扎埃及。这意味着第五马其顿军团是历史上存在时间最长的罗马军团，从公元前43年到公元637年，整整680年，第五马其顿军团见证了罗马从共和国时期到帝国时期，再到东罗马帝国的时代变迁