华东理工大学生物工程学院（School of Bioengineering ECUST）是
华东理工大学二级学院。
办学历史
1955年，抗生素教研组成立，隶属有机工业系，抗生素制造工学专业开始招生，学制5年。同时抽调化学制药工学专业1953、1954年进校的部分学生转入抗生素制造工学专业学习，并按4年学制如期毕业。
1956年，获准招收国家首批
副博士研究生（抗生素制造工学专业）。
1959年，抗生素制造工学专业更名为抗菌素工学专业。
1972年，
上海科学技术大学生物物理化学系（创建于1958年）调入学校。
1976年，工业生化专业招收工农兵学员，学制3年。
1977年，恢复高考后抗菌素专业、生物化学专业招生，学制4年。
1978年，生物化工硕士点获得批准。
1979年，工业生化专业更名为生物化学专业。
1980年，抗菌素学专业更名为生物化学工程专业。
1982年，生物化学工程系成立，下设生物化学工程和生物化学两个专业并辖辐化科研组。
1985年，生化工程研究所成立。
1986年，在原有专业食品方向的基础上，食品工程专业开始招生。
1990年，生物化工博士学位授权点（全国第一个）获得批准。
1994年，生物化学研究所成立，食品工程专业更名为食品科学与工程专业。
1995年，
生物反应器工程国家重点实验室通过验收并对外开放。
1996年，成立生物工程学院，成立
国家生化工程技术研究中心（上海）。学院辖生物化学工程系、应用生物学系、生化工程研究所、生物化学研究所、生物反应器工程国家重点实验室、国家生化工程技术研究中心（上海）、华东生物技术工程公司、华震科贸技术公司。
1998年，在生物化学专业的基础上成立应用生物化学系。
1999年，生化工程系改名为生物工程系，生物化工专业更名生物工程专业；生物化学专业更名生物科学专业；增设生物技术专业，学制4年。生物化工专业改为生物工程专业；应用生物化学系的生物化学专业改名为生物科学专业，并另成立了生物技术专业。
2000年，海洋生化工程研究所正式成立。
2001年，国家生化工程技术中心（上海）正式挂牌，生化工程与技术学科通过教育部“211工程”项目验收，生物工程学科被批准为上海市重点学科。
2003年，被批准为发酵工程博士学位授权点。
2005年，食品科学与工程系成立。
2006年，被批准为生物化学与分子生物学博士学位授权单位。
2007年，发酵工程被批准为上海市重点学科。生物工程实验教学中心成立。
2008年，增设食品质量与安全专业，学制4年。生物工程专业被批准为成为
国家特色专业。
2011年，轻工技术与工程一级学科博士点获得批准。发酵工业分离提取技术研发中心成立。
2012年，轻工技术与工程
博士后科研流动站获得批准。
2014年，上海生物制造产业技术研究院暨协同创新中心成立，上海海洋动物疫苗工程技术研究中心获批筹建。
2015年，生物工程一级学科博士点获得批准，成为国内第一个生物工程学位授权点。
2016年，生物反应器工程国家重点实验室被科技部评估为优秀实验室。生物工程专业通过国家工程教育认证。
2018年，教育部批准华东理工大学与德国
勃兰登堡工业大学合作举办生物工程专业本科双学位教育项目。
2019年，生物工程博士后科研流动站获得批准。
办学条件
院系设置
截至2017年12月，学院设有3个系（生物工程系、应用生物学系、食品科学与工程系），5个本科专业（生物工程、生物科学、生物技术、食品科学与工程、食品质量与安全）。
师资力量
截至2017年12月，学院有教职工170人，其中专任教师中具有正高职称40人，副高职称56人；博士生导师35人、硕士生导师80人。国家杰出青年科学基金获得者（含B类）2名，“973”首席科学家2名，“863”领域专家2名，国家优青1名，入选中组部万人计划1名，入选科技部中青年科技创新领军人才1名，全国优秀教师1名，聘任杨胜利院士、张永莲院士、欧阳平凯院士等担任特聘教授、客座教授、名誉教授。
双聘院士：
杨胜利（中国工程院院士）、张永莲（中国科学院院士）
国家杰出青年科学基金获得者：张立新(2011年)
教育部“新世纪优秀人才”：
魏东芝、
叶邦策、
刘琴、
钱江潮上海市浦江人才：
鲍杰、
范立强、钱江潮、
花强、
曹旭妮、刘少伟、史萍、叶朝阳、马兴元、白云鹏、周勉全舒、周胜敏、
王启要、阳大海、
范建华教学建设
截至2017年12月，学院有国家特色专业1个，教育部卓越工程师计划试点专业1个，上海市示范实验教学中心1个；3门国家精品课程，5门上海市精品课程，1门上海市重点课程。
国家特色专业：生物工程
国家精品课程：《发酵工程》、《酶工程》、《生物分离工程》
教育部卓越工程师计划试点专业：生物工程
上海市示范实验教学中心：发酵工程示范实验教学中心
上海市精品课程：《基因工程》、《生物药物工程》、《生物化学》、《微生物学》、《细胞工程》
上海市重点课程：《基因组学》
学科建设
截至2019年10月，学院有国家重点学科1个，上海市重点学科2个；博士后科研流动站2个，一级学科博士点1个，二级学科博士点2个，一级学科硕士点2个，二级学科硕士点4个，专业硕士学位领域2个。
博士后科研流动站：化学工程与技术、轻工技术与工程、生物工程
一级学科博士点：生物工程
二级学科博士点：生物化工、生物化学与分子生物学
一级学科硕士点：生物学、生物工程
二级学科硕士点：生物化工、生物化学与分子生物学、食品科学、微生物学
专业硕士学位领域：生物工程、食品工程
国家重点学科：生物化工
上海市重点学科：生物工程、发酵工程
学术研究
科研平台
根据2018年10月学院官网信息显示，学院有1个国家重点实验室，1个国家工程技术研究中心，1个中国轻工业重点实验室，1个上海工程技术研究中心。
国家重点实验室：生物反应器工程国家重点实验室
国家工程技术研究中心：国家生化工程技术研究中心（上海）
中国轻工业重点实验室：中国轻工业生物基材料工程重点实验室、
上海工程技术研究中心：上海海洋动物疫苗工程技术研究中心
科研成果
根据2018年10月学院官网信息显示，学院承担数项国家重点研发计划、“973”计划、“863”计划、重大专项、国家科技支撑计划、自然科学基金重点项目或课题，各类纵向课题到帐经费近4亿元；横向课题帐经费超过6000万元；以第一完成单位获得省部级一等奖以上科技奖励7项，其中国家科技进步二等奖和技术发明二等奖各1项；专利授权150多件，发表学术论文1050多篇，其中SCI收录650余篇。
学术资源
《生物资源与生物加工》（Bioresources and Bioprocessing，简称BRBP）是学院生物反应器工程国家重点实验室与Springer-Nature合作出版的高质量开放获取型英文学术期刊。
文化传统
生物工程学院院徽设计理念：标志设计为图文标志，由外圈和中心两部分的图形元素组成。内圈图形为DNA分子的视觉抽象符号，意为阶梯与皇冠，碱基对由上至下的透视效果，意为生物工程学院走向辉煌的未来。中间金字塔形的元素意味生物工程的基础“细胞”并以抽象的视觉符号加以概括，寓意：1.细胞是构成生命的基础，之间巧妙的连接，构成生命的诞生，以图形符号体现生物的视觉；
2.三角形是最稳定的构成。由学生、教师、支持学院的各界人士构成坚固的生物工程学院。中心由1955数字表达，为学院前身全国第一个抗生素制造工学专业创立时间。标志颜色为蓝色，与学校校徽遥相呼应，给人以深邃、睿智、纯净、能量之感。
现任领导
知名校友
张霞昌，芬兰华人科学家，“2006影响世界华人”。
杨胜利，中国科学院上海生物工程研究中心研究员，中国工程院院士。
李永舫，高分子化学、物理化学专家，中国科学院院士，
中国科学院化学研究所有机固体重点实验室研究员，
苏州大学材料与化学化工学部特聘教授。
刘昌胜，
华东理工大学党委常委、
副校长，中国科学院院士。
田斌，新泽西州州立罗格斯大学微生物与分子遗传学部教授。