察隅自然保护区地处青藏高原的东南边缘，核心区在察隅县中部，1985年建立，为西藏自治区省级自然保护区，与其它乡镇地位平级。保护区因保护的自然资源不同而分为慈巴沟、拉木弄巴、窘东和矢朱三个部分。慈巴沟区内有700多只扭角羚。拉木弄巴有许多珍贵用材树种及许多药用植物，窘东和矢朱草本层发达，总盖度为80%。

总面积为101400公顷。主要保护对象为森林生态系统及树种种质资源。属于林芝地区素有“西藏江南”之称的察隅县。以保护亚热带常绿阔叶林、亚热带珍稀动物种类，云南松高产林为目的，是西藏东南角气候温暖湿润、物种丰富、森林生态系统比较完整的地区。

保护区内无人居住，在整个保护区内，森林原始景观十分完整，珍稀野生动物活动频繁，其中有孟加拉虎、熊、豹、穿山甲、全雕、绯胸鹦鹉、蟒等。在未建保护区之前曾有少数猎人入沟狩猎，使珍稀野生动物数量有所下降；建立保护区后，狩猎现象基本被杜绝，区内野生动物数最大量增加。

保护区位于西藏自治区东南边缘察隅县境内，地处青藏高原的东南边缘。

保护区属喜马拉雅山山地，区内沟谷纵横交错，海拔1500~3000米。由于地势向南倾斜，印度洋的西南季风沿沟谷能直接伸入，气温较高，降水量也很丰富，年降水量变化在700~1000毫米之间，年均温变动于11~15℃，形成温暖潮湿的气候。因此，察隅地区素有西藏“江南”之称，鲜明的江南色彩到处可见。优越的自然条件为察隅地区的亚热带森林生态系统的形成奠定了基础。成为青藏高原上不可多得的一块宝地。

保护区因保护的自然资源不同而分为慈巴沟、拉木弄巴、窘东和矢朱三个部分。

慈巴沟位于察隅县城西南方约45公里。以保护山地亚热带常绿阔叶林及其栖息的野生动物为主。植物种类丰富，仅维管束植物就达1000种左右。森林植物区系复杂，有较多的孑遗植物和被子植物的原始类群，其中尤以木兰科、水青树科等的种类为代表。经济林木和药用植物种类繁多。如肉桂、天麻、三七、虫草、猕猴桃、猴头菌、贝母等。国家重点保护动物有长尾灰叶猴、云豹、雪豹、黑麂、扭角羚、猕猴、棕熊、小熊猫、棕颈翠鸟、红腹锦鸡、血雉等。区内扭角羚有700多只。

棕颈翠鸟：国家二级保护动物。佛法僧目、翠鸟科。体长约1300毫米，雄鸟的头、颈和胸部为金棕色。雌鸟的颈部为黑色。喙长大，喙基两侧具黑白相间的条纹。初级飞羽的羽尖和尾羽的下半段为白色。

棕颈翠鸟为留鸟。栖息于热带、亚热带密林中。以榕树果等肉质丰富的果实为食，有时捕捉小鸟。夏季繁殖，在树洞内营巢。

拉木弄巴位于下察隅的贡日嘎布曲的西南岸，海拔高度一般变化于1600~3000米。在这里山地亚热带常绿和落叶阔叶混交林发育良好，大多数保持着原始状态。植物种类十分丰富，仅高等植物就有1000多种。代表植物如壳斗科的曼青冈、青冈栎，楝科的香椿，木兰科的南亚含笑、绒叶含笑，樟科的紫桂。此外还有山茶科、五加科、杨柳科、忍冬科、槭树科、桦木科、卫矛科、紫金牛科、木犀科等的植物也是森林的常见树种。森林中还有许多珍贵用材树种及许多药用植物，如五味子、天麻、黄连、桂皮等。

窘东和矢朱两个保护点位于拉木弄巴的察隅河畔。海拔约1700米，地势平缓。发育着云南松林，这里的云南松林是我国云南松林分布的西界。灌木蕨类云南松林是保护区中主要的类型。林木生长高大、迅速，群落层次结构虽然简单，但是植物种类丰富，林相整齐，乔木层郁闭度为0.5~0.6，平均高度变动于30~50米，平均直径约40~84厘米，蓄积量为500~920立方米/公顷，是云南松林中生产力最高的一种类型。下木层总盖度达到30%以上，以中生喜温的灌木为主，其中最有代表的是巴氏木蓝、大叶蔷薇、绢毛蔷薇、粉枝梅以及米饭花等。草本层发达，总盖度为80%，蕨类是最具代表的优势种，总盖度达50%。

国家保护植物，二级有澜沧黄杉、水青树、长蕊木兰、星叶草、云南黄连，三级有长苞铁杉、红花木莲、楠木、厚朴、红椿、锡金海棠、黄牡丹、黄芪、桃儿七、假人参、延龄草、天麻等。

云南松：木材淡橙黄色，材质松软、细密，为建筑、枕木、板材、家具及木纤维工业的重要原料。云南松可割取松脂、提炼松香和松节油，且质量较高；树皮含鞣质、松脂、松节油；枝、叶、幼果、花粉等均可入药；伐根可培养茯苓和松菇，在综合利用方面有广阔前景。特别是由于云南松生长迅速，根系发达，适应性强，天然更新良好，是西藏中山地带重要的造林绿化树种。察隅自然保护区成为这一重要的种植资源库。