袁懋功，字九叙，乃香河县延福屯人，后举家迁入香河县城内。然功祖上袁婴（字和叔）乃宋朝淳熙年间进土，曾官至礼部侍郎。袁家祖籍乃浙江鄞县，后廷余姚，于明初又迁至香河。懋功父亲袁邦化（号敬事）曾在明末崇祯年间做过山西沁水县丞，明清交替之际代理过沁水知县，后于清顺治初年辞职归家。袁邦化膝下有二子，长子懋德，曾于清初做过通政使，次子便是懋功。

据《清史稿》袁懋功列传记载：袁懋功，字九叙，顺天香河人。顺治三年进士，授礼科给事中。疏请慎简学官，磨勘文体，釐定礼制。又以前明废官援恩诏踵至，请敕吏部会都察院严覈才品。累擢户部侍郎。十七年，世祖谕懋功才品敏练，授云南巡抚。时云南初定，懋功令降卒入籍归农，垦无主之田。编保甲，以时稽察。奏减屯田粮额，请停派部员履勘田亩。抚云南九载，政绩大著。以父忧去。服除，起山东巡抚。康熙十年，济南五十六州县卫新垦地被淹，懋功疏请展限一年起科，部格不行，上特允之。调浙江，未行，卒，谥清献。

上述记载较为简略。其实袁懋功在外任巡抚之前担任过很多官职，并且两次被降官降级。其在顺治三年任礼科给事中，五年任刑科给事中。顺治十年，以集议总兵任珍罪，坐党附镌级。不久就擢任太常寺少卿，累迁至通政司通政使。顺治十二年，擢刑部侍郎，寻调任吏部侍郎。十三年，以议免员外郎朱世德亏税事，降光禄寺少卿。十六年，擢都察院左副都御史，是年底又擢户部右侍郎。

顺治十七年，滇中初定，特简袁懋功为云南巡抚，赐袍、马并帑金三千以俾治装。清朝封疆大吏一般都有兼衔，袁懋功任云南巡抚时领兵部左侍郎衔兼都察院右副都御史。袁懋功至滇后，宣布恩信，整治疮痍，恢复生产，加强治安，并令土官子弟赴学宫训课，其优者并许应试。行之九载，颇有成效。时吴三桂骄横有异志，袁懋功镇之以静，其部曲皆爱重之，无敢犯其法者。

康熙六年，以父忧归。九年，起授山东巡抚。圣祖召见，询问慰劳，赐蟒服、鞍马。在任仁慈廉静，正己率下，一如抚滇时。十年五月，黄河决口，济南大水，五十六州县卫新垦地皆被淹，袁懋功疏请展限一年起赋，格于部议。袁懋功于病中口占遗疏，犹剀切争之，疏中有“臣即填沟壑，死无恨”之语，圣祖感动，如所请行。康熙十年秋九月卒，年六十，赐祭葬如例，谥清献。

清刘献廷《广阳杂记》记载：袁懋功抚滇时，丁外艰归，轿围用白毡。或曰：“昔某公遭艰归，于轿顶之中，为一小龛，奉纸位一，载而行。”懋功将用之，一友曰：“公非宗子。神所依之主在六完老先生所，若公复奉一主，是神有二矣。此礼，惟长房长子得行，公奔走可也。”懋功拜而谢之。

山东巡抚袁懋功与浙江巡抚范承谟都是康熙初年著名的清官，有“南范北袁”之称。袁懋功不仅为官清廉，而且确为地方经济之才。其抚山东时，浙江巡抚范承谟因病请辞，朝廷拟以袁懋功改任浙江巡抚，山东各界通过官府奏请将袁懋功留任山东，诏下之时，袁懋功已积劳成疾，康熙特在诏书御批令袁懋功“卧治山东”。

康熙十年（1671年），与袁懋功齐名的两浙巡抚范公因病请求辞职，朝廷打算派袁改任，巡抚两浙。圣旨下后，山东地方各界纷纷通过督河制府和驻山东大帅府奏请朝廷将袁留任，朝廷准奏。下诏之时，袁已因辛劳成疾，康熙帝在诏书上批了“卧治山东”之语。

袁懋功国辛劳加中暑，背起毒疮，痛苦异常，因留任圣旨已下，他不好再上辞职奏章，只好带重病卧床处理政务。到了这年秋季，他病情稍减，又亲自下各州府调查处理案件数日，以至；日病复发，日益严重，医药已难再治。临终前，他口述道疏，言山东省内灾荒还未能根除，农业还未有大的发展，请求朝廷给沂水、金衣新城等地百姓以宽厚政策，使逃荒农民得以回归安居。在整个遗流中，末谈及任何私人请求。袁终时正值康熙十年（1671年）9月（公历10月），享年60岁。遗流传至朝廷，内外震动，悲恸、惋惜之情不绝朝野。

袁懋功卒后归葬之时，山东沿途哭拜者不绝于路，有数百人护送灵柩到香河。袁懋功被安葬于香河县大王庄村前的袁家祖坟内，墓前有石碑，上面刻着保和殿大学士李霨撰文、兵部尚书朱之弼书丹的《袁清献公墓志铭》。

袁懋功与魏象枢为同榜进士。袁懋功卒后，魏象枢曾作《挽袁九叙同年巡抚山左卒于官》诗曰：节钺重开抚二东，清操惠政许谁同。百年鼎望归梧凤，数载深劳起泽鸿。风雨漫催双鬓老，弟兄真惜此人空。回思滕馆分襟日，萧索秋心寄野蓬。