1640年是一个闰年，是农历庚辰年，是龙年。年号为明崇祯十三年，清崇德五年。它的第一天在星期日开始。

2月7日，总兵官左良玉，总督陕西三边侍郎郑崇俭等大败张献忠于太平县之玛瑙山。当时义军分为三路，西路张献忠据楚蜀界、东路革里眼、南路曹威、过天星等。

3月7日，崇祯帝下诏罢各镇内臣。告谕道：“各镇内员，察饬已久。兵马、钱粮、器械等项，稍有改观，但战守防援，事权未能尽一。遂将总监、分守等内臣俱撤回京另用，凡边务一切钱粮、兵马、边防、剿御等事，着督、府、镇、道一意肩承。

3月14日，户科给事中左懋第疏陈四弊：民困、兵弱、臣工委顿、国计虚耗等。又请严禁将士剽掠、请散米钱，赈济饥民。崇祯帝采纳其言，诏令上灾七十五州县所旧练三并停，中灾六十八州县止征练饷，下灾二十八州县等到秋后征饷，并令清理刑狱。

4月，为筹措军费，镇压苏格兰起义，查理一世被迫召开中断了11年之久的议会。

4月15日，崇祯帝告谕吏部臣：年来资格畛域，抑坏人才。考选屡奉旨举贡兼收，究竟不遵，非祖宗破格用人至意。就教贡士并试过岁贡生共二百六十三人，俱着于六部司属、都察院、通政司、太常寺各司属及推知正官通行察缺，依次填补。此系特用，后不为例。

5月，巴塞罗那爆发了起义；为了镇压这次起义，葡萄牙的贵族们都收到了动员令，让他们去加泰罗尼亚参战。

5月13日，苏、松、湖等府的吴江、归安等地昼夜倾盆大雨，水势骤发，霎时汹涌，不分堤岸，屋宇倾倒。而米价腾踊，斗米至银三四钱，富家多闭粜，民食草木根皮俱尽，抛妻子死者相枕。强横之徒三五成群，鼓噪就食，街坊罢市，乡村闭户人情汹汹。

5月16日，崇祯帝告谕户部、都察院：直省告饥，而畿辅、山东、河南、山西、陕西，又有百姓茹土食菜，并无菜色，且剜肉爨骨，殣以泽量，言之堕泪。

6月29日，崇祯帝诏辑《武经七书大全》，命大学士范复粹为总裁，礼部右侍郎黄锦、少詹事李绍贤为副总裁，右赞善胡世安、修撰刘理顺、编修方拱乾等为纂修官，开馆编辑。

7月，张献忠西走白羊山与罗汝才会合。此时曹威、过天星欲渡江，为明官兵所阻。张献忠至，与之会合。

7月14日，罗汝才与明总兵孙应元等战于兴山之丰邑坪，被官军斩二千三百余级，俘五百余人。罗汝才率其众逸走巫山，与张献忠队伍会合。

7月15日，临清副总兵黄胤思上《海运图》。

8月，杨嗣昌出师入蜀，其时监军万元吉先入蜀，令蜀将把守巴、巫等险要之地。

9月，李自成从郧、均进入河南。起初李自成被围于鱼腹山中（四川奉节县东），时义军中人多出降于官军，李自成欲自尽，为养子双喜劝止。李自成部下刘宗敏杀己妻对李自成说，要誓死从君。军中壮士闻之，也多杀妻子誓从李自成。李自成乃尽焚辎重，轻骑入河南。

9月6日，明军兵败于观音岩。当时万元吉驻守巫山，邵捷春驻于大昌，互相声援。

9月8日，汤若望将修好的旧琴连同另一件外国进献的乐器一起献给了崇祯皇帝。

11月，杨嗣昌率军进重庆。监军万元吉擢前总兵猛如虎为正总统，张应元为副，率军趋绵州，分派诸将把守要害之处，元吉自小路至射洪，在蓬溪处以待义军。义军分驻安岳界，侦知官军至，乃退至内江，如虎追之，元吉、应元则在安岳城下扼守。

12月，下诏增天下关税。崇祯初年，关税每两增一钱，崇文门、河西务、临清、九江、浒墅、扬州、北新、淮安八关，增五万两。不久，又增二钱。户部尚书毕自严，议“增南京宣课司税额一万为三万”，南京户部尚书郑三俊以“宣课所收落地税无几，请税芜湖以抵增数”，自严乃上疏议“税芜湖三万，而宣课仍增一万”。后乃以度支日绌，增加关税二十万两，而商人百姓日益穷困。

12月1日，葡萄牙从西班牙统治下重新获得独立。

6月5日，《聊斋志异》作者蒲松龄诞辰。

张景岳（1563－1640），明末会稽（今浙江绍兴）人，名介宾，字惠卿，号景岳，因其室名通一斋，故别号通一子。同时因为他善用熟地，有人又称他为“张熟地”。古代中医温补学派的代表人物。时人称他为“医术中杰士”、“仲景以后，千古一人”，其学术思想对后世影响很大。

蔡国用逝世：蔡国用（？－1640），字正甫，江西金溪人。万历三十八年（1610）进士，由中书舍擢御史。历大理寺丞、少卿，天启五年（1625），因忤魏忠贤意，勒令闲住。崇祯元年（1628）起故官，屡迁工部右侍郎，崇祯十一年升礼部尚书兼东阁大学士入阁。十二年六月，以边功，进太子太保、户部尚书、文渊阁大学士。十一月以叙守城功，进吏部尚书武英殿大学士，十三年六月二十日卒于官，赠太保，谥文恪。国用入阁三载，居位清谨，碌碌无所建树。

2月，穆拉德四世(Murad IV，1612～1640)奥斯曼帝国第十七任素丹，因酗酒过度而死。

5月30日，比利时画家鲁本斯逝世

李信投归李自成：李信为杞县举人，故尚书精白之子。崇祯十三年（1640）十二月投归李自成。李信因父列名逆案，欲洗刷其罪，曾出米千石救济饥民，民称之为“李公子”。时红娘子反，掳信。信逃归，自首于官府，官囚之。红娘子与饥民共劫狱，杀知县而返，并挟李信投归李自成。李自成改信名曰岩。李自成提出“杀一人如杀我父，淫一人如淫我母”，李岩编有“迎闯王，不纳粮”的歌谣，并提出“均田免粮”等口号。使义军军纪肃然。义军迅速发展壮大。牛金星投归李自成：牛金星为卢氏举人，以磨勘被斥，私自入李自成军作主谋，后潜归，事发后坐罪当斩。已而，从轻发落。遂于崇祯十三年（1640）十二月投归李自成。

宋献策投归李自成：崇祯十三年（1640）十二月，宋献策由牛金星所荐，投归李自成。宋献策善卜，上谶给李自成，上书“十八子，主神器”自成大喜。

玛瑙山之战

崇祯十三年（1640）二月初七日，杨嗣昌驻襄阳，而令左良玉专剿张献忠。左良玉率军与张献忠战于枸平关（陕西兴安县西），献忠败。左良玉请从汉阳西乡入蜀追之。杨嗣昌令左良玉别派偏将追剿，左良玉不从。时张献忠移军至九滚坪，见玛瑙山险峻，将据之。左良玉军至山下，而张献忠已占据山巅，左良玉乃分兵三路，约闻鼓而上，鏖战久之，张献忠军败。左良玉兵折扫地王曹威，白马邓天王等义军首领十六人。张献忠妻妾被擒，张献忠逃入兴、归山中。不久又入兴安、房县境，官军畏惧山险不攻，张献忠潜伏密林中，贿山民买盐米，山民成为义军耳目，张献忠收得散士，声势复振。

罢各镇内臣

崇祯帝破格用人

苏州、松江、湖州等府大水

崇祯帝恤民疾苦

崇祯十三年（1640）五月十六日，或天灾流行，人谋感召，贪婪助旱魃之虐，繁苛鼓冯夷之波。民生其间，勿死何待。近虽屡颁轸恤之诏，充耳不闻。今闻惰媮者玩世不遵，虐恢者又奉行未善，各地方官给发积谷银钱若干？赈济招徕流徙复业若干人？田地荒芜，有无给种买犊，多方开垦？富室乡绅，果否输资发粟，设法鼓劝？蠲停钱粮，曾否榜示通知，俾沾实惠？该抚按官以察吏安民为务，务要减从躬行郡县察勘，即以地方饥徒之有无，察官属之殿最。

农民军入川

崇祯十三年（1640）七月，张献忠虽累败，然气犹盛，立马江边，有不前者，辄斩之，官兵乃退，张献忠渡江后，屯驻万顷山，此时杨嗣昌才自夷陵朔舟而上。而张献忠势力已盛，连续攻下大昌、开县，北攻剑州，将入汉中。又攻绵州、泸州，至开县。杨嗣昌在重庆，召贺人龙、左良玉来援，皆不至。

李自成入河南

明军兵败观音岩

崇祯十三年（1640）九月初六日，明军兵败于观音岩。当时万元吉驻守巫山，邵捷春驻于大昌，互相声援。后捷春用其部将之言，认为大昌上、中、下马渡，水浅地平，难以把守，乃兵分三处，各派三四百人以守，义军突至，先破上马渡。元吉急令诸将汇于潭家岭、七篝坎、乾溪等处，又派张奏凯兵屯净壁。捷春派罗洪政、沈应龙二将助之。而张献忠已攻破净壁，趋大昌，遂攻陷大昌。

增天下关税

蒲州府大饥

崇祯十三年（1640）大饥，草木皆被吃光，官府于城门外掘坑以埋饿死者，埋且满，饥甚无食的人争到坑内割食其肉，至有父子夫妇相食者。

山东沂州蝗灾

崇祯十三年（1640），蝗遍野盈尺，百树无叶，赤地千里，斗麦二千。民掘草根剥树皮，父子相食，骸骨纵横，婴儿捐弃满道，人多自竖草标求售，辗转沟壑者无算。1641年春疫疠继起，死亡过半。