陈九畴，字禹学，山东曹州（今菏泽）人，明朝弘治十五年（1502）进士，官至副都御史、宁夏巡抚。

陈九畴为人倜傥多权略。从诸生开始，就练习武事。

弘治十四年（1501）举人，弘治十五年（1502）进士，任刑部主事。有重囚越狱，没人敢于招惹，陈九畴挺槊追捕到他，于是以武健闻名。

正德初年，录囚南直隶，因没有行贿而得罪刘瑾，贬官广东阳山知县。刘瑾被诛，官复原职。历任郎中，平定赛杨虎狱变。陈九畴跟随彭泽平定蓝廷瑞鄢本恕起义，升任肃州兵备副使。总督彭泽派遣哈密都督写亦虎仙前往贿赂土鲁番，陈九畴奋然说：“彭公受天子命，制边疆，不能身当利害，何但模棱为！”于是陈九畴练卒伍，缮营垒，常若临大敌。写亦虎仙果然私通敌军。敌军首领、速檀满速儿进犯嘉峪关，游击将军芮宁败死。后来满速儿再次派遣斩巴思等以驼马求和，而暗中修书给写亦虎仙及其姻党阿剌思罕儿、失拜烟答等为内应。陈九畴知敌计，将阿剌思罕儿及斩巴思捉住并打入大牢。通事毛监等守之。毛监等以前就与他们勾结，欲放走他们，众番皆等待机会叛乱。陈九畴察觉后，处死毛监等人。敌军失去内应，于拔帐退兵。兵部尚书王琼厌恶彭泽，弹劾他“启边衅”，彭泽罢官，牵连陈九畴失事罪，打入大牢。以失拜烟答死于狱中为罪，罢官为民。

明世宗即位，官复原职。不久，升任陕西按察使。数月后，甘肃总兵官李隆教唆部卒殴打杀害巡抚许铭，焚烧其尸。于是擢升陈九畴右佥都御史、甘肃巡抚，查验许铭之事，诛杀李隆及为首的乱卒。陈九畴到达任所后，进言额军七万余人，存者不及一半，且多老弱，请求下令召募。朝廷下诏同意他的意见。

嘉靖三年（1524），速檀满速儿再次以二万余骑兵包围肃州。陈九畴自甘州昼夜疾驰五百里入城，鏖战七日，射击敌军，敌军多死。陈九畴又出兵击退敌军。总兵官姜奭击败分掠甘州的敌军。论功，进副都御史，赏赐金币，甘肃等处皆为他建立生祠。陈九畴上言：“番贼敢入犯者，以我纳其朝贡，纵商贩，使得熟悉虚实也。写亦虎仙逆谋已露，输货权门，转蒙宠幸，以犯边之寇，为来享之宾。边臣怵利害，拱手听命，致内属番人勾连接引，以至于今。今即不能如汉武兴大宛之师，亦当效光武绝西域之计。先后入贡未归者二百人，宜安置两粤，其谋逆有迹者加之刑僇，则贼内无所恃，必不复有侵轶。倘更包含隐忍，恐河西十五卫所，永无息肩之期也。”事下，总制杨一清颇为采纳其建议。

嘉靖四年（1525）春，致仕归乡。

起初，土鲁番败走，都指挥王辅进言速檀满速儿及牙木兰俱死于炮击，陈九畴将捷报上奏。后速檀满速儿及牙木兰上表请求通贡，明世宗感到奇怪且怀疑。而在京师的番人制造蜚语，言肃州之围，由陈九畴激起，明世宗愈加相信。遇上百户王邦奇揭发杨廷和、彭泽，牵连陈九畴。吏部尚书桂萼等希望通过陈九畴，扳倒彭泽，于是请求允许通贡，而追治陈九畴激变罪。大学士杨一清进言事已前决。明世宗不听，将陈九畴下诏狱。刑部尚书胡世宁在朝上说：“世宁司刑而杀忠臣，宁杀世宁。”于是上疏为陈九畴申冤说：“番人变诈，妄腾谤讟，欲害我谋臣耳。夫其畜谋内寇，为日已久。一旦拥兵深入，诸番约内应，非九畴先几奋僇，且近遣属夷却其营帐，远交瓦刺扰其窟巢，使彼内顾而返，则肃州孤城岂复能保？臣以为文臣之有勇知兵忘身殉国者，无如九畴，宜番人深忌而欲杀也。惟听部下卒妄报，以满速儿等为已死，则其罪有不免耳。”最后，法司具狱如胡世宁所言。明世宗采纳了桂萼等的进言，陈九畴谪戍极边。十年后，赦免还乡。

嘉靖十八年（1539），遇上饥荒，陈九畴捐出粟百斛、俸金六百赈灾。

《明史》：陈九畴、翟鹏、孙继鲁、曾铣皆可用之才，或谪或死，不以其罪。

杨一清：文以润武，武以济变，当今一人而已。

胡世宁：文臣之有勇知兵忘身殉国者，无如九畴。

在菏泽城东四里，赵王河西岸。