康熙十三年（1674），
吴三桂进攻
湖南，
顺承郡王勒尔锦率军讨伐，高其位跟随出征，
署任参领，驻防
襄阳。叛将
杨来嘉、王会等率两万人劫掠
郧西、
谷城、
南漳等县，高其位率二十骑侦察敌情，遇敌于土地岭，知到敌军将要进犯南漳，于是高其位骑马越过敌军，受伤不退，直入南漳城，通知加强守备。敌军直逼城下三日，不能攻克而遁逃。
康熙十五年（1676）正月，叛将
谭洪率军三万，水陆进犯
郧阳，高其位率百人扼守杨谿铺，相持七十余日，粮食耗尽后，煮
马鞯为食。等到
副都统李林隆率军救援，于是合击击溃敌军。
康熙五十六年（1717）九月，高其位上书请求辞职，康熙帝嘉奖他
和辑兵民，声名素优，令
供职如旧。
雍正元年（1723）二月，命仍回提督任。四月，上奏请求保护
圣躬。雍正帝褒奖他：“此奏字句之外，实有一片爱君之心，发乎至诚，非泛泛虚文可比。”
雍正二年（1724）三月，上奏进言
松江的泖湖、淀湖、澄湖港汊丛杂，江浙错壤与
太湖毘连，经两省
督抚与臣委官勘议，防奸法计。松江所属通船要口一百十三处，钉椿立栅，以时启闭，官捐工料，百姓乐趋，事将次告成。谕以权宜措施，必无碍商民乃善。七月，上奏飞鸦食蝗，秋禾丰茂。雍正帝认为蝗不成灾，传示王公大臣，并赐诗褒奖他：“禆益军民资伟略，剂调文武在和衷”。十月，上奏进献
黄浦江渔船网鱼所得双
夔龙纽未刻玉印，雍正帝下谕：“此事若出自他人，非卿奏闻，朕不信也。卿乃忠信老成，
封疆大臣，断不至有揑造虚诞之举，以阿谀取容，今赐卿数物以示嘉悦。”赐高其位四
团龙补服。
雍正三年（1725）五月，雍正帝对
廷臣说：“提督高其位以前署任总督时，
年羹尧上奏其年老
衰惫，两耳
重听，
贪位隐饰，贻误地方，不应委以重任，所以先帝降旨罢其署理。等朕即位，犹记年羮尧之言，特召高其位来京
陛见。朕视其为人老成忠厚，
善气迎人，虽已年老，精力犹可任用。适值年羹尧在京，遂令伊询问高其位，观汝筋力尚可，为朕效力数年，不得
固辞。目下现有
銮仪使一缺、旗下
都统一缺，着量其力之所能，自行陈奏。彼时高其位上奏都统事务向来不甚熟练，銮仪卫又无可效力之处，朕遂降旨令回松江。此乃出自朕意，加恩老臣，并非年羹尧赞助之力在。年羮尧必隐其从前之
参劾，反
市德于高其位，而高其位不知，亦以为出于年羹尧赞助之力也。去年，高其位上奏进献松江渔船所获玉宝，朕赏以四团龙补服等物，又适值年羮尧在京，必又向高其位居功，冀其感激。听说年羹尧将一无赖小人推荐给高其位，高其位即授以
把总，不久，又提拔为
千总。此事向来在
督抚提镇中皆所不免，年羹尧尤视为常事，但高其位以前被年羹尧参劾，及朕加种种之恩，皆特出朕意，与年羹尧毫无干涉，而年羹尧窃君恩为己功，高其位奉私嘱如公令，即此见年羹尧之巧诈营私、随处要结，而内外臣工之为所愚者不少矣。”九月，授
文渊阁大学士，兼
礼部尚书，加
太子少傅，高其位以年老体衰，不胜机务，上奏推辞。雍正帝没有同意，下诏：“等受代后，即来京供职”。
雍正四年（1726）五月，到达京城，改隶汉军镶黄旗。不久，请求退休，雍正帝下谕：“跪拜艰难，
高年常有之事，不必遽行求退”。十月，高其位度过八十生辰，雍正帝赐扁联及服食等物，银千两。十一月，高其位再次请求退休，得旨：卿宣力年久，恪慎奉职，
老成练达，茂着贤声，是以简预机务，用昭优眷，前以老病乞休，朕未忍俞允，特命供职数时，以示眷念耆旧大臣之至意。今复行奏请，情词恳切，准以原官
致仕”。