乾隆六年(1741)七月,兼管
武备院事。侍郎
梁诗正上奏
八旗兵丁当分置
边屯,阿里衮奉命与
大学士查郎阿到
奉天相度地势。阿里衮上奏:“地宜耕者,
吉林乌拉东北
拉林、阿尔楚克,阿尔楚哈东飞克图,
齐齐哈尔东南呼兰,西南黑尔苏站、刷烟站,白都讷东八家子至登额尔者库,皆沃壤;呼兰东佛忒喜素素富林木,惟地高下各异。
墨尔根寒暑早,齐齐哈尔砂碛,吉林乌拉无余地,
宁古塔山深,乌苏里产人参,皆不宜耕。”
乾隆七年(1742)五月,议政王大臣采纳了他的意见,移屯自拉林、阿尔楚哈始。七月,兼管
奉宸苑事。
乾隆八年(1743)四月,
湖南巡抚许容弹劾
粮道谢济世狂放不羁,
总督孙嘉淦请求革去谢济世的职务,
御史胡定以许容挟私诬陷入奏,阿里衮奉命审理,得到许容冤枉谢济世,孙嘉淦徇私包庇的真相,谢济世复职,许容论罪,孙嘉淦革职,乾隆帝命阿里衮署任湖南巡抚。六月,署任
河南巡抚。十月,任
山西巡抚。
乾隆十四年(1749),
讷亲被诛,令分别承担为讷亲偿还债务。不久以兄弟不相及,命免之。乾隆帝准备巡视
五台山,阿里衮上疏请求于台怀建
行宫,
太原就
巡抚官署增建群室,乾隆帝不许。阿里衮上疏推荐大学士
傅恒之弟、
参将傅谦,乾隆帝责问其不当,下诏切责。
乾隆十六年(1751)四月,
湖北巡抚唐绥祖被前任总督永兴、
布政使严瑞龙弹劾罢官,阿里衮奉命同
河南巡抚鄂容安会审,上陈唐绥祖无受贿的情况,永兴被罢官。九月,改任
两广总督。平定
东莞人莫信丰叛乱。
丁母忧回京。九月,补任
户部侍郎。十月,兼管
工部事务。
乾隆二十一年(1756)四月,命
军机处行走。清军逐捕
阿睦尔撒纳,定西将军
达尔党阿出西路。五月,命阿里衮辅佐达尔党阿,在
领队大臣上行走。九月,大军至雅尔拉,斩五百七十余人,擒十一人。追至努喇,遇到敌军两千人,奋勇鏖战,生擒
宰桑扎南布,斩三百四十余人,得到嘉奖。十月,命与达尔党阿回京。
乾隆二十二年(1757)正月,
乾隆帝以
成衮扎布为定边左副将军,会师
巴里坤,阿里衮仍在领队大臣上行走。二月,达尔党阿以失阿睦尔撒纳削爵,阿里衮牵连降职
户部侍郎。六月,兼任正白旗蒙古
副都统。
回部大和卓布拉呢敦、
小和卓霍集占分别占据
叶尔羌、
喀什叛乱,沙拉斯、玛呼斯等游牧部落与他们呼应。九月,阿里衮与都统
满福自阿斯罕布拉克、什特勒克取道至哈喇沙尔,搜山杀敌。再次进军至塔本顺和尔、纳木噶,俘男妇二百余人。十二月,满福被叛将郭多克哈什哈诱杀,沙拉斯、玛呼斯遁逃
库车。阿里衮进军之哈喇沙尔西南
库尔勒。
乾隆二十三年(1758)正月,逐敌至呼尔塔克山,擒获玛呼斯得木齐额默根等。四月,阿里衮自鲁克察还师,驻军巴里坤。乾隆帝先得
伯克素赉玛的上奏,阿里衮在搜捕玛哈沁的时候准备还师,与阿里衮上疏所说的师向呼尔塔克山不相对应,乾隆帝责问阿里衮中途拖延,罢免他的侍郎职务,以副都统革职留任。六月,靖逆将军
雅尔哈善攻打库车,霍集占救援,入城放守,后逃至叶尔羌。乾隆帝罢免了雅尔哈善,而督促定边将军
兆惠攻打
阿克苏,进逼叶尔羌。十一月,命阿里衮选马三千、驼七百增援兆惠。兆惠攻打叶尔羌不克,濒黑水结寨,霍集占为长围困之。乾隆帝听说后,授
富德定边右将军、阿里衮
参赞大臣,支援兆惠。历任
吏部侍郎。该月,命袭封二等
公爵。十二月,擢升
兵部尚书、
正红旗蒙古都统。
乾隆二十四年(1759)正月,富德率军至呼尔璊,霍集占出战,五日四夜未决。阿里衮以驼马至,乘夜分师为两翼斫阵,斩千余级。布拉呢敦中创,与霍集占败走。支援兆惠全师以还。乾隆帝以阿里衮送马济军,如期集事,且杀贼多,加
云骑尉世职,按例进爵一等公爵。七月,霍集占逃至
巴达克山,阿里衮与富德等率军追逐,降其众一万二千多人。阿里衮以五百人驻伊西勒库尔淖尔西堵截拔达克山
要隘,复分兵出其南,遇敌,夺其家属辎重,降二千多人。再选兵二百人逾岭逐敌。巴达克山投降,献出霍集占的首级。九月,命以
参赞大臣留叶尔羌办事。十月,行赏,赐阿里衮
双眼花翎。
乾隆二十五年(1760),召还京师,赐
紫禁城内骑马。六月,自喀什行至叶尔羌,遇到雅木扎尔回酋迈喇木煽动叛乱,假称阿睦尔撒纳复入阿克苏。阿里衮回到喀什,率八百人以出,至伯什克勒木,迈喇木等以千余人拒战,阿里衮率军击破敌军。敌军入城坚守,麾兵合围,夜四鼓,城人呼号乞降,迈喇木遁去。乾隆帝嘉奖阿里衮应机立办,授他的儿子
拜唐阿丰升额蓝翎侍卫。阿里衮捕捉到迈喇木等送至京师,复进丰升额
三等侍卫,授其次子倭兴额为蓝翎侍卫。十月,阿里衮回到京师,授
领侍卫内大臣,图形
紫光阁。
乾隆三十一年(1766)春,将军
明瑞深入
缅甸,乾隆帝授阿里衮参赞大臣,驰传至军。二月,明瑞战死于猛腊,大学士傅恒任
经略,授阿里衮及
阿桂为副将军,并令暂领
云贵总督,率师驻
永昌。朝议:“明年进兵。今岁秋夏瘴退,先收
普洱、
思茅边外诸小部落。”阿里衮上疏进言:“边外十三板纳皆内属不为乱,惟召散、整贝、猛勇三部附缅甸。”当用兵时,
刑部尚书舒赫德在军中,与
云南巡抚鄂宁密疏议抚。六月,缅甸使
头人请降,被阿里衮拒绝,以闻。乾隆帝命置毋答,并谴责舒赫德等。七月,阿里衮上疏请求断绝与缅甸贸易,并治云南
省城至
永昌道,抚慰沿边诸土司,借帑俾市籽种牛具,得到采纳。十二月,阿桂兵至,共同发兵出边,未深入而还。
乾隆三十四年(1769)二月,乾隆帝摘抄云贵总督明德上疏的语句,以军中马羸责问阿里衮等人,下部议夺职,命宽免。三月,傅恒到达军队,与阿里衮等商议渡过戛鸠江,西攻猛拱(今缅甸
密支那之西)、猛养(今缅甸密支那)两
土司,直取缅甸首都
阿瓦(今缅甸
曼德勒)。
偏师至猛密,夹江而下,造舟蛮暮通往来。七月,大军前进。起初,阿里衮患
痈疮,乾隆派遣太医诊治良愈,此时再次复发。傅恒令阿里衮留永昌治疾,阿里衮坚持请行。师进,缅甸兵不出。十月,傅恒还师蛮暮,进攻
老官屯,驻戛鸠江口。缅甸兵水陆并至,傅恒、阿桂驻军江东,阿里衮驻军江西,迎战。敌军结寨自固,阿里衮率兵七百攻之,敌军百余人弃寨而走。
贵州把总姚卓杀敌,夺其旗,大军锐进,敌军四百余人遁逃。再次交战,天已傍晚,敌军不能坚守,纷纷撤去。阿里衮攻破三个寨子,杀敌五百余人。乾隆帝下谕旨:“初次接仗,即能如此获胜,朕览奏,甚为欣慰”。傅恒同样得病,诸将商议不能再进兵,阿里衮说:“老官屯敌寨,前年额尔登额没有攻克。距此仅
一舍,不破之何以报命?”策马而行,傅恒以下皆从之,寨子坚固,无法攻克。阿里衮病重,强起督战,视枪炮最多处则以身当之。傅恒虑其有伤,令他率领舟师,不再攻寨。十二月,卒于军中,谥襄壮,入祀
贤良祠。以丰升额
平定大小金川的功绩,追加封号为果毅继勇公。
乾隆帝:①富德入援,次呼尔璊。趱行戈壁,马不进焉。以马济军,敌营夜袭。同事建绩,曰鄂博什。②昨岁秋之仲,盛京谒陵园。三大功臣墓,陪葬其间存。兹阿里衮者,额都四世孙,勇岂匹其祖。忠实一例肫,兆惠阻黑水,囘众如蜂屯。尔时舒赫德,统兵速入援。又被狂狙阻,进退至两难。适值阿里衮,送马继进遄。率兵亦弗多,乘夜贼营掀。贼骇自天降,鹿埵群逃奔。两军俱善归,重进鸿功全。后复往征缅,受瘴惜陨身。一再忘躯劳,思之辄泪扪。幸而子善继,金川建殊勋。凯全以病终,悲惜何忍言。